181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0324 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 		 478 aa  934    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  49.48 
 
 		 516 aa  435  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  51.23 
 
 		 513 aa  425  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  49.27 
 
 		 496 aa  416  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  47.08 
 
 		 547 aa  397  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  40.17 
 
 		 485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  39.35 
 
 		 498 aa  299  7e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  39.57 
 
 		 483 aa  291  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  35.61 
 
 		 500 aa  276  7e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  37.95 
 
 		 497 aa  275  9e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  37.95 
 
 		 488 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  38.81 
 
 		 487 aa  273  5.000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  38.79 
 
 		 484 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  43.17 
 
 		 511 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  37.15 
 
 		 487 aa  259  6e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  36.21 
 
 		 474 aa  259  9e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  38.15 
 
 		 482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  40.31 
 
 		 486 aa  252  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  40.31 
 
 		 486 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  34.77 
 
 		 489 aa  251  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  40.62 
 
 		 486 aa  246  6e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  40.82 
 
 		 487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  43.52 
 
 		 374 aa  239  8e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  41.39 
 
 		 339 aa  239  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  41.32 
 
 		 334 aa  233  5e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  42.25 
 
 		 423 aa  223  7e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  41.56 
 
 		 393 aa  199  7.999999999999999e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  38.99 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  36.45 
 
 		 375 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  35.6 
 
 		 374 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  35.6 
 
 		 374 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  35.6 
 
 		 368 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  37.54 
 
 		 396 aa  179  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  37.3 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  38.95 
 
 		 391 aa  170  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  33.64 
 
 		 349 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  35.29 
 
 		 351 aa  162  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  35.42 
 
 		 346 aa  154  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  33.33 
 
 		 365 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  34.59 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  32.78 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  32.99 
 
 		 341 aa  149  8e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  31.89 
 
 		 408 aa  146  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  32.18 
 
 		 355 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  33.97 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  33.65 
 
 		 420 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  32.45 
 
 		 366 aa  143  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  33.21 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  35.69 
 
 		 347 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  32.61 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  32.75 
 
 		 429 aa  137  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  32.64 
 
 		 393 aa  137  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  30 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  33.22 
 
 		 346 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  31.93 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  31.91 
 
 		 335 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  33.45 
 
 		 420 aa  123  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  31.25 
 
 		 327 aa  106  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  29.75 
 
 		 672 aa  89.4  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2651  DHH family protein  28.01 
 
 		 652 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0151664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2973  DHH family protein  28.01 
 
 		 652 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  28.48 
 
 		 898 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3413  diguanylate cyclase and phosphoesterase  28.93 
 
 		 658 aa  73.2  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3542  diguanylate cyclase and phosphoesterase  28.36 
 
 		 658 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0080  phosphoesterase RecJ domain protein  27.3 
 
 		 667 aa  70.5  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.609068  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3758  phosphoesterase domain-containing protein  26.58 
 
 		 684 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1184  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.28 
 
 		 905 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2258  phosphoesterase, RecJ-like protein  26.19 
 
 		 669 aa  67  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0125063  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  26.95 
 
 		 888 aa  65.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  28.39 
 
 		 904 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0532  Inorganic diphosphatase  26.6 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4010  diguanylate cyclase and phosphoesterase  26.25 
 
 		 657 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874769  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  29.61 
 
 		 880 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  26.02 
 
 		 1077 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  29.5 
 
 		 880 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1946  Inorganic diphosphatase  29.95 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.25 
 
 		 892 aa  60.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1967  signal protein  28.31 
 
 		 675 aa  60.8  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.764897  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0212  hypothetical protein  26.4 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0533  phosphoesterase RecJ domain protein  24.3 
 
 		 669 aa  58.9  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5263  diguanylate cyclase and phosphoesterase  26.73 
 
 		 657 aa  59.3  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129533  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0788  signal protein  23.68 
 
 		 654 aa  58.5  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0653759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5597  DHH subfamily 1 protein  25.53 
 
 		 657 aa  57  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0188603  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5338  DHH subfamily 1 protein  25.53 
 
 		 657 aa  57  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00027618  hitchhiker  0.000000025759 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  28.08 
 
 		 896 aa  57  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.62 
 
 		 903 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  27.87 
 
 		 888 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0011  signal protein  26.11 
 
 		 672 aa  56.2  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00560638  hitchhiker  0.0000000733083 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.62 
 
 		 903 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0880  phosphoesterase RecJ domain protein  23.51 
 
 		 667 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.631011  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  30.04 
 
 		 875 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.06 
 
 		 903 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0654  phosphoesterase, DHHA1  30.29 
 
 		 330 aa  54.7  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0418861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5621  DHH subfamily 1 protein  29.46 
 
 		 657 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000144841  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1582  phosphoesterase RecJ domain protein  24.6 
 
 		 339 aa  54.3  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000783458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5323  DHH subfamily 1 protein  29.46 
 
 		 657 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5151  DHH family phosphoesterase  29.46 
 
 		 657 aa  53.9  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5167  DHH family phosphoesterase  29.46 
 
 		 657 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5719  DHH subfamily 1 protein  29.46 
 
 		 657 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5658  DHH subfamily 1 protein  29.46 
 
 		 657 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000148947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>