More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1833 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1833  response regulator receiver protein  100 
 
 		 136 aa  282  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2144  response regulator receiver protein  43.18 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1609  response regulator receiver protein  37.76 
 
 		 155 aa  97.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1710  response regulator receiver protein  37.06 
 
 		 155 aa  97.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.198048  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0205  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1271  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2148  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3148  response regulator receiver protein  37.8 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4403  response regulator receiver protein  37.8 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  31.67 
 
 		 539 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_1394  predicted protein  31.36 
 
 		 550 aa  60.1  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1097  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 		 915 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2801  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1041 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1826  sensor protein TorS  29.51 
 
 		 1000 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.811683  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3365  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1009 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4293  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.28 
 
 		 1011 aa  55.1  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.291525  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  30.89 
 
 		 942 aa  54.3  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2743  two component LuxR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 		 873 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2754  two component LuxR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 215 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2938  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.33 
 
 		 215 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2846  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.33 
 
 		 215 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.243379  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2131  response regulator, histidine kinase  31.2 
 
 		 958 aa  53.9  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.739788  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  32.79 
 
 		 833 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 901 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.135172  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02206  hypothetical protein  33.33 
 
 		 827 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3747  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.91 
 
 		 781 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.244728  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 589 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0113735 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2694  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 386 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.236755  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 		 524 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.4 
 
 		 937 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 1362 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1977  histidine kinase  40 
 
 		 534 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.313704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 		 1033 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 903 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0791  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 1118 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3232  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 1118 aa  50.8  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 1182 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45485  ethylene receptor 1  32.14 
 
 		 833 aa  50.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.454805  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.56 
 
 		 948 aa  50.8  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3335  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 1122 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 1121 aa  50.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 		 1124 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1079  CBS sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 		 512 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.721589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2689  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 624 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1966  response regulator receiver domain-containing protein  27.27 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25170  hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 642 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  39.13 
 
 		 982 aa  50.1  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 		 1020 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2964  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.88 
 
 		 647 aa  50.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 		 984 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 128 aa  50.1  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3215  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 		 1030 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2178  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 		 750 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00477296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1152  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 		 1025 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 1266 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  35.14 
 
 		 654 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3242  two component LuxR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 213 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000371761  hitchhiker  0.000468813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 		 822 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3215  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 		 1020 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  31.71 
 
 		 1141 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.67 
 
 		 937 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2035  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 		 750 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3728  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 		 750 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1089  DNA-binding response regulator RprY  28.75 
 
 		 245 aa  49.3  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.414682 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  27.55 
 
 		 207 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 827 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0930  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  31.3 
 
 		 745 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.407663  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4471  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 		 627 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.611462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 		 898 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2939  response regulator receiver protein  31.17 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2656  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 		 713 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.363366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 		 645 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2127  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 815 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 1596 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0811  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 661 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 		 586 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276724  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2671  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 		 841 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.74 
 
 		 773 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03837  Signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 		 623 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  38.1 
 
 		 900 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.17 
 
 		 918 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1874  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 575 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.807127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3532  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 		 996 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.403445 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09498  two-component system, transcriptional regulatory protein  29.17 
 
 		 236 aa  48.5  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 		 944 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 		 647 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0909  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 		 1333 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257325  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55187  diatom histidine kinase like  26.42 
 
 		 541 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 1158 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5715  putative two-component sensor  30.7 
 
 		 750 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.901003  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2547  histidine kinase  28.32 
 
 		 698 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.795977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1132 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65860  putative two-component sensor  29.82 
 
 		 770 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.73 
 
 		 926 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1263  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 		 687 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.618033  normal  0.0213865 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01755  putative two-component member protein  28.91 
 
 		 1111 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  31.88 
 
 		 2109 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2196  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.81 
 
 		 473 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405028 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6525  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 216 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>