68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1461 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1461  LicA protein  100 
 
 		 267 aa  540  1e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  35.77 
 
 		 622 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 622 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  31.7 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  29.03 
 
 		 522 aa  115  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  32.09 
 
 		 383 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  31.94 
 
 		 383 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1288  choline/ethanolamine kinase family protein  36.89 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.006168  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1107  choline/ethanolamine kinase family protein  36.89 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.531729  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  24.21 
 
 		 592 aa  79.3  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  24.8 
 
 		 589 aa  77.8  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  27.8 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  23.23 
 
 		 595 aa  74.7  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  24.05 
 
 		 596 aa  72.8  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  25.48 
 
 		 611 aa  70.5  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  24.15 
 
 		 619 aa  69.3  0.00000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  25.19 
 
 		 590 aa  68.9  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  23.62 
 
 		 603 aa  65.5  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf798  PTS lichenan-specific IIa component  28.41 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  24.91 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  20.17 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  23.47 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  20.16 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  20.25 
 
 		 324 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1738  aminoglycoside phosphotransferase  22.89 
 
 		 379 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  20.16 
 
 		 314 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  21.13 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1889  aminoglycoside phosphotransferase  21.28 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0866  hypothetical protein  29.37 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0105  aminoglycoside phosphotransferase  29.17 
 
 		 314 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0176137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  20.58 
 
 		 307 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  24.14 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  22.36 
 
 		 311 aa  49.3  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2749  aminoglycoside phosphotransferase  19.61 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.589565 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1663  aminoglycoside phosphotransferase  40.68 
 
 		 367 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2481  aminoglycoside phosphotransferase  38.18 
 
 		 382 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.469146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1805  aminoglycoside phosphotransferase  38.18 
 
 		 389 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  21.77 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  21.72 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1454  aminoglycoside phosphotransferase  37.04 
 
 		 342 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.599627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  21.72 
 
 		 311 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1797  aminoglycoside phosphotransferase  38.18 
 
 		 384 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1844  aminoglycoside phosphotransferase  38.18 
 
 		 392 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.812957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  18.84 
 
 		 311 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2712  hypothetical protein  37.29 
 
 		 379 aa  46.2  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3530  aminoglycoside phosphotransferase  24.66 
 
 		 338 aa  45.4  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410504  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2497  aminoglycoside phosphotransferase  40.38 
 
 		 434 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.403294  hitchhiker  0.00457096 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1409  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1977  thiamine kinase  24.03 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3867  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499671  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3188  choline/ethanolamine kinase  18.32 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2307  aminoglycoside phosphotransferase  40.38 
 
 		 409 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2377  aminoglycoside phosphotransferase  34.55 
 
 		 434 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  normal  0.630893 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1322  thiamine kinase  21.25 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209926  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2161  thiamine kinase  24.03 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000171857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1284  thiamine kinase  24.03 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2795  thiamine kinase  30.23 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1456  hypothetical protein  28.12 
 
 		 314 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1923  thiamine kinase  36.84 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.592165  hitchhiker  0.0000295844 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2318  aminoglycoside phosphotransferase  34.55 
 
 		 356 aa  43.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3408  aminoglycoside phosphotransferase-like  21.65 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0833457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3824  hypothetical protein  41.46 
 
 		 406 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.372888  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02802  Choline kinase involved in LPS biosynthesis  27.1 
 
 		 240 aa  42.7  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.994431  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  31.82 
 
 		 315 aa  42.7  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1831  aminoglycoside phosphotransferase  22.03 
 
 		 353 aa  42.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  30.23 
 
 		 297 aa  42  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1529  hypothetical protein  41.3 
 
 		 332 aa  42  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4016  hypothetical protein  43.9 
 
 		 255 aa  42  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>