48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3867 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3867  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
264 aa  533  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499671  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2966  aminoglycoside phosphotransferase  49.01 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14970  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  46.85 
 
 
256 aa  208  7e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.448489  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2262  aminoglycoside phosphotransferase  43.55 
 
 
253 aa  192  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.657806 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35590  phosphotransferase family protein  39.41 
 
 
269 aa  149  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.886492  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2326  aminoglycoside phosphotransferase  31.2 
 
 
256 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4777  aminoglycoside phosphotransferase  30.34 
 
 
281 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.266614  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5377  aminoglycoside phosphotransferase  28.63 
 
 
265 aa  98.6  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.556886  normal  0.652804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6530  aminoglycoside phosphotransferase  31.85 
 
 
238 aa  96.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0352215  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3328  aminoglycoside phosphotransferase  23.37 
 
 
264 aa  96.3  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1068  aminoglycoside phosphotransferase  36.6 
 
 
252 aa  95.1  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0761  aminoglycoside phosphotransferase  33.71 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230447  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1734  aminoglycoside phosphotransferase  35.56 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1230  trifolitoxin immunity domain-containing protein  23.46 
 
 
263 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000170799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1183  trifolitoxin immunity protein  23.37 
 
 
263 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00210871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1288  trifolitoxin immunity domain protein  23.55 
 
 
263 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000214818  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1053  trifolitoxin immunity domain-containing protein  23.55 
 
 
262 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000137711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1133  trifolitoxin immunity domain-containing protein  23.55 
 
 
262 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000583619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1028  trifolitoxin immunity protein  23.55 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102871  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1031  trifolitoxin immunity protein  23.94 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3172  aminoglycoside phosphotransferase  35.85 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0232436  hitchhiker  0.0000000099783 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4156  trifolitoxin immunity protein  22.61 
 
 
263 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000289256  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5537  aminoglycoside phosphotransferase  31.39 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72204  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1186  aminoglycoside phosphotransferase  34.97 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000753  hypothetical protein  24.9 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2772  aminoglycoside phosphotransferase  28.97 
 
 
285 aa  82  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04894  hypothetical protein  24.8 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5213  putative aminoglycoside phosphotransferase protein (antibiotic resistance protein)  35.15 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1296  aminoglycoside phosphotransferase  35.22 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240005  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4227  aminoglycoside phosphotransferase  28.74 
 
 
324 aa  78.6  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.722733 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0079  aminoglycoside phosphotransferase  30.83 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7402  hypothetical protein  30.92 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1421  putative trifolitoxin immunity protein  32.45 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2954  aminoglycoside phosphotransferase  31.88 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00316699  decreased coverage  0.00012693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1395  putative trifolitoxin immunity protein  33.14 
 
 
243 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.815075  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2798  aminoglycoside phosphotransferase  34.15 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1471  putative antibiotic resistance protein  24.29 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.292447  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1013  aminoglycoside phosphotransferase  29 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2126  aminoglycoside phosphotransferase  32.47 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.171035  normal  0.0430024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0822  hypothetical protein  33.14 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740155  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2040  aminoglycoside phosphotransferase  27.34 
 
 
277 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1212  trifolitoxin immunity protein  28.46 
 
 
140 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3956  aminoglycoside phosphotransferase  31.79 
 
 
251 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1984  putative TfxG-like immunity protein against TfxA-like peptides  28.8 
 
 
291 aa  56.6  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  34.38 
 
 
302 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  30 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2484  putative spore coat protein  41.3 
 
 
342 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0028881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2194  spore coat protein, putative  37.29 
 
 
342 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00168617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>