60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1406 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1406  repressor protein  100 
 
 		 211 aa  435  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  45.64 
 
 		 235 aa  168  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  47.79 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  32.26 
 
 		 421 aa  99.8  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  30.92 
 
 		 331 aa  98.2  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3217  putative phage repressor  33.81 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111001  normal  0.682159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  30.12 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  42.86 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  27.59 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  27.95 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  31.06 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  30.64 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  28.48 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  27.75 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  25.43 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  27.49 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  25.36 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  28.74 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  26.09 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  29.75 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  26.09 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  30.48 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  27.53 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  25.47 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  25.9 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  31.29 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1234  putative prophage repressor  34.44 
 
 		 153 aa  53.1  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000530915  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  37.5 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  27.05 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  26.02 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  25.3 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  42.59 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000495428  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  26.51 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1808  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630846  normal  0.212121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1772  putative prophage repressor  41.51 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000601077  decreased coverage  0.000377038 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3666  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100264  decreased coverage  0.0000000000010366 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  22.95 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  23.92 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.02 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  27.78 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0696  putative prophage repressor  27.08 
 
 		 157 aa  45.1  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00336277  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3360  putative phage repressor  23.11 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  29.11 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  23.66 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  27.38 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  27.61 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  30.77 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  23.7 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  26.07 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  29.63 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  35 
 
 		 246 aa  42.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  27.47 
 
 		 230 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  23.15 
 
 		 231 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 209 aa  42  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  24.14 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>