More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2938 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 304 aa  623  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  85.86 
 
 		 305 aa  550  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  82.84 
 
 		 313 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  80.46 
 
 		 305 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  79.8 
 
 		 305 aa  511  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  77.48 
 
 		 305 aa  495  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  74.26 
 
 		 305 aa  485  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  59.6 
 
 		 314 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  59.6 
 
 		 314 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  59.6 
 
 		 313 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  59.27 
 
 		 314 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  55.78 
 
 		 303 aa  361  8e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  53.97 
 
 		 303 aa  358  7e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  55.3 
 
 		 303 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  53.85 
 
 		 303 aa  355  6.999999999999999e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  52.48 
 
 		 303 aa  347  1e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  55 
 
 		 307 aa  344  8.999999999999999e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  53.67 
 
 		 303 aa  343  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  53.82 
 
 		 312 aa  336  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  51.66 
 
 		 303 aa  335  5.999999999999999e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  51.83 
 
 		 318 aa  326  3e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  52.27 
 
 		 308 aa  325  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  51.49 
 
 		 306 aa  322  5e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  53.47 
 
 		 305 aa  321  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  51.16 
 
 		 307 aa  319  3e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  50.33 
 
 		 306 aa  314  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  49.34 
 
 		 308 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  46.84 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  49.67 
 
 		 304 aa  302  4.0000000000000003e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  51.99 
 
 		 306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  46.69 
 
 		 310 aa  285  5e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  44.11 
 
 		 297 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  44.63 
 
 		 302 aa  252  5.000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  31.92 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  24.64 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  37.93 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  24.73 
 
 		 285 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  25.52 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  25.09 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  25.09 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  25.16 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  25.16 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  29.14 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  25.09 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3268  PfkB domain protein  27.21 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.266121 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  25.09 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  25.09 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  29.76 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  24.72 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  27.08 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  39.08 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  24.72 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  33.64 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  38.39 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  32.37 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  26.09 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  31.25 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  33.04 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  33.04 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  37.61 
 
 		 313 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  32.48 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  33.68 
 
 		 314 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  25.74 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  35.34 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  27.21 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  30.43 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  35.29 
 
 		 348 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  27.93 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  29.84 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  32.48 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  25 
 
 		 317 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  32.41 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  34.96 
 
 		 328 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  27.24 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  37.74 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0612  ribokinase-like domain-containing protein  25.65 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.27452  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  24.91 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  31.62 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  33.06 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  40.74 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  38.75 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  29.91 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  29.29 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  27.27 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  26.26 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  27.61 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2948  ribokinase-like domain-containing protein  26.24 
 
 		 283 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.64332 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  34.82 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  27.52 
 
 		 319 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  29.67 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  36.61 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  32.77 
 
 		 316 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3037  PfkB domain protein  23.84 
 
 		 348 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272424 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  38.46 
 
 		 311 aa  53.1  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  33.63 
 
 		 302 aa  52.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3416  ribokinase-like domain-containing protein  33.04 
 
 		 311 aa  53.1  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  35.63 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  36.59 
 
 		 293 aa  52.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  26.92 
 
 		 296 aa  52.8  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>