More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2413 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  68.71 
 
 		 445 aa  659    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 445 aa  924    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  69.61 
 
 		 446 aa  668    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  53.88 
 
 		 446 aa  508  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  51.95 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  48.74 
 
 		 465 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  46.43 
 
 		 447 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  49.74 
 
 		 421 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  43.84 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  44.27 
 
 		 450 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  41.36 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  43.13 
 
 		 437 aa  385  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  38.12 
 
 		 461 aa  329  7e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3016  radical SAM domain-containing protein  39.58 
 
 		 513 aa  216  7e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  28.54 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  35.64 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 		 345 aa  104  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 		 355 aa  90.9  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  31.77 
 
 		 340 aa  87.8  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  28.92 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  31.71 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  29.27 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  32.81 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  29.47 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  29.96 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  29.96 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  27.18 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1233  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.02 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63882  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  33.16 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  28.8 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.42 
 
 		 298 aa  72.8  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  21.27 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  28.8 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  27.13 
 
 		 873 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  27.63 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.74 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  29.56 
 
 		 387 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4147  molybdenum cofactor synthesis-like  30.65 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  29.53 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.19 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2567  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.76 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  26.77 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.76 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2269  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.99 
 
 		 345 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  26.26 
 
 		 329 aa  66.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.02 
 
 		 299 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.72 
 
 		 298 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  25.52 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  24.94 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  29.9 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4564  molybdenum cofactor synthesis-like  30.81 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2295  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.74 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  24.58 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1706  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.11 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0251054  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  24.87 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0519  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.11 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19300  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.96 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00282794  normal  0.0296768 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2803  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.11 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000449435  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1815  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.11 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184643  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2919  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.11 
 
 		 370 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00151708  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0056  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.31 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0808361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2790  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.11 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00347388  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4222  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.88 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2492  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.11 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0107198  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2864  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.11 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.61 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34160  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.31 
 
 		 339 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.142269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0904  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.73 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0102552  normal  0.0824176 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 		 331 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.06 
 
 		 330 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0969  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.17 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1387  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.5 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1755  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.44 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2288  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.07 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4751  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.52 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.83 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.637479  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0989  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197702  normal  0.914992 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.04 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1832  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.96 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0355  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.59 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1061  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.16 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.5 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2923  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.16 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.545573 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  31.06 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1348  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.13 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0260  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.85 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  30.19 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.88 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292381  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1535  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  30.11 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.495642 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  29.32 
 
 		 341 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  29.32 
 
 		 347 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  26.4 
 
 		 335 aa  59.7  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2357  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.84 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.719976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>