More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1770 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  68.52 
 
 		 606 aa  847    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  65.02 
 
 		 650 aa  838    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 602 aa  1229    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  55.43 
 
 		 589 aa  664    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  69.75 
 
 		 622 aa  857    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  65.54 
 
 		 647 aa  852    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  55.56 
 
 		 608 aa  654    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  47.86 
 
 		 628 aa  569  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  42.17 
 
 		 608 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  42.17 
 
 		 605 aa  462  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  42.41 
 
 		 607 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  42.16 
 
 		 607 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  42.04 
 
 		 601 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  38.94 
 
 		 632 aa  421  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  37.56 
 
 		 647 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  38.79 
 
 		 625 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  38.86 
 
 		 602 aa  402  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  39.19 
 
 		 611 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  38.12 
 
 		 615 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  38.59 
 
 		 613 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  39.78 
 
 		 644 aa  395  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  37.62 
 
 		 623 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  38.76 
 
 		 633 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  38.15 
 
 		 630 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  39.97 
 
 		 612 aa  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  36.33 
 
 		 603 aa  391  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  38.92 
 
 		 632 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  40 
 
 		 629 aa  389  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  38.6 
 
 		 632 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  39.67 
 
 		 610 aa  388  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  37.99 
 
 		 633 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  39.17 
 
 		 632 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  39.54 
 
 		 606 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  38.29 
 
 		 644 aa  382  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  37.4 
 
 		 641 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  37.88 
 
 		 691 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  38.03 
 
 		 636 aa  382  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  38.58 
 
 		 621 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  37.75 
 
 		 661 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  38.6 
 
 		 616 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  38.22 
 
 		 636 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  37.95 
 
 		 633 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  38.14 
 
 		 633 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  38.45 
 
 		 611 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  38.7 
 
 		 619 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  37.34 
 
 		 616 aa  377  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  35.53 
 
 		 641 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  37.95 
 
 		 661 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  39.42 
 
 		 622 aa  378  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  34.36 
 
 		 614 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  37.48 
 
 		 648 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  37.72 
 
 		 612 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  37.17 
 
 		 600 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  37.66 
 
 		 645 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  35.94 
 
 		 639 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  36.55 
 
 		 647 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  37.02 
 
 		 600 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  33.44 
 
 		 559 aa  367  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  38.6 
 
 		 621 aa  369  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  36.78 
 
 		 635 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  34.76 
 
 		 630 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  37.75 
 
 		 603 aa  368  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  37.11 
 
 		 635 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  37.8 
 
 		 635 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  38.6 
 
 		 648 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  36.26 
 
 		 631 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  36.75 
 
 		 643 aa  364  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  36.48 
 
 		 598 aa  365  2e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  37.5 
 
 		 705 aa  365  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  38.55 
 
 		 597 aa  365  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4225  DNA mismatch repair protein MutL  36.51 
 
 		 687 aa  362  8e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.724774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  35.91 
 
 		 644 aa  362  8e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  37.79 
 
 		 594 aa  362  1e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  37.48 
 
 		 565 aa  361  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  36.47 
 
 		 617 aa  360  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  36.45 
 
 		 605 aa  360  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  35.23 
 
 		 640 aa  359  9e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  38.1 
 
 		 626 aa  359  9e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  37.88 
 
 		 603 aa  358  9.999999999999999e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  35.45 
 
 		 623 aa  358  1.9999999999999998e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  35.45 
 
 		 623 aa  358  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  37.62 
 
 		 604 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  34.24 
 
 		 624 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  38.03 
 
 		 603 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  37.2 
 
 		 620 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  34.73 
 
 		 611 aa  356  6.999999999999999e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 		 656 aa  356  6.999999999999999e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  37.46 
 
 		 661 aa  355  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  37.19 
 
 		 605 aa  355  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  33.5 
 
 		 572 aa  355  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  33.59 
 
 		 659 aa  355  2e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  36.21 
 
 		 575 aa  355  2e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  36.98 
 
 		 628 aa  354  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  37.64 
 
 		 597 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  35.66 
 
 		 574 aa  353  5e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  34.32 
 
 		 584 aa  352  8e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  35.51 
 
 		 626 aa  352  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  37.3 
 
 		 660 aa  351  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  32.35 
 
 		 645 aa  350  3e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  36.45 
 
 		 605 aa  350  3e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>