67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1218 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  278  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  56.82 
 
 		 132 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  57.26 
 
 		 132 aa  166  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  40 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  44.35 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  41.22 
 
 		 134 aa  104  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  39.13 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  39.26 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  39.06 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  41.41 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  41.46 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  37.98 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  39.69 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  38.28 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  36.72 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  37.96 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  33.59 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  34.38 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  36.15 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  35.94 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  42.74 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  41.18 
 
 		 99 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  31.58 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  34.88 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  34.38 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  30.08 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  33.82 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  33.58 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  34.88 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  34.33 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  33.61 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  38.26 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  33.59 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  35.25 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  32.56 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  31.88 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  31.88 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  31.88 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  31.88 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4680  hypothetical protein  33.59 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  34.45 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4601  hypothetical protein  32.59 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4580  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0417201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4409  hypothetical protein  32.59 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.901332 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0032  hypothetical protein  32.59 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.475298  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4418  hypothetical protein  32.59 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200049  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5266  hypothetical protein  26.77 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5593  hypothetical protein  26.77 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  30.88 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3887  hypothetical protein  26.15 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  31.45 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  45.45 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1712  hypothetical protein  24.6 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  28 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0134  hypothetical protein  29.63 
 
 		 132 aa  42.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501544  normal  0.0368693 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  38.46 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  24.6 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  37.14 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  32.58 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0550  hypothetical protein  34 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1381  CopG family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  23.64 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1685  hypothetical protein  27.16 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>