More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4256 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4256  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 310 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2997  alpha/beta hydrolase fold protein  46.67 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.670306 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0513  putative hydrolase  46.99 
 
 		 290 aa  192  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7821  alpha/beta hydrolase fold protein  43.4 
 
 		 290 aa  192  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1199  alpha/beta hydrolase fold protein  47.35 
 
 		 294 aa  192  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00792158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8394  putative hydrolase  43.08 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06630  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  44.76 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3833  alpha/beta hydrolase fold protein  42.54 
 
 		 302 aa  165  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.549204 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0822  alpha/beta hydrolase fold protein  43.46 
 
 		 278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000139933  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0473  hypothetical protein  32.18 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.225161  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.06 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  27.38 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.59 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  29.28 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  32.09 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  28.75 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  33.19 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  27.72 
 
 		 602 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  29.61 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.14 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0772  alpha/beta fold family hydrolase  25.74 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  29.87 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  28.93 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  25.62 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  27.52 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  28.85 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  41.32 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  28.1 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0626  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  39.78 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2789  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 250 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  29.15 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00980  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.52 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  23.75 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4169  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  41.59 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  25.85 
 
 		 602 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  37.7 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.09 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5402  3-oxoadipate enol-lactonase  29.25 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.81 
 
 		 270 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  28.11 
 
 		 260 aa  57  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2527  esterase-like  27.07 
 
 		 280 aa  57  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  39.82 
 
 		 337 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 252 aa  57  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  27.71 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3216  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 271 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  41 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1674  alpha/beta hydrolase fold protein  31.72 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0555007  normal  0.342209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  27.7 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  26.58 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.13 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  31.36 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  34.42 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 		 261 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4462  alpha/beta hydrolase fold protein  31.49 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>