More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4237 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4237  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
451 aa  865    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3795  peptidase M16-like  53.43 
 
 
448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.417189  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0932  peptidase M16 domain-containing protein  50 
 
 
455 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513926  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0864  peptidase M16 domain protein  49.89 
 
 
462 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1776  peptidase M16 domain-containing protein  49.17 
 
 
438 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06880  predicted Zn-dependent peptidase  46.26 
 
 
462 aa  364  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408528  normal  0.0872557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3746  peptidase M16 domain-containing protein  51.13 
 
 
447 aa  354  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4127  peptidase M16 domain-containing protein  50.11 
 
 
447 aa  347  3e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1583  peptidase M16 domain protein  47.39 
 
 
453 aa  318  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115865  normal  0.227723 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0082  peptidase M16 domain-containing protein  34.05 
 
 
477 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281002 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  32.64 
 
 
439 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  32.64 
 
 
439 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  32.41 
 
 
439 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  30.4 
 
 
921 aa  156  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  28.64 
 
 
479 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  27.49 
 
 
943 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  30.29 
 
 
439 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3568  peptidase M16 domain-containing protein  36.27 
 
 
448 aa  149  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.742239  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  29.05 
 
 
496 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  28.28 
 
 
478 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3239  zinc protease  23.96 
 
 
427 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00842119  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0705  peptidase M16 domain protein  23.34 
 
 
427 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1590  peptidase M16 domain protein  24.76 
 
 
424 aa  140  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.508475  normal  0.157035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5951  peptidase M16 domain protein  27.75 
 
 
426 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  28.44 
 
 
494 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  26.46 
 
 
487 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  27.73 
 
 
495 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  25.35 
 
 
497 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0109  peptidase M16 domain protein  24.88 
 
 
456 aa  137  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  26 
 
 
486 aa  137  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  28.01 
 
 
495 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  30.07 
 
 
896 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  25.24 
 
 
487 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  29.09 
 
 
767 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02700  putative metallopeptidase, M16 family protein  27.79 
 
 
687 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  25.29 
 
 
492 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  25.29 
 
 
487 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2345  peptidase M16 domain protein  26.45 
 
 
490 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.854323 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  25.35 
 
 
492 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  27.92 
 
 
954 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  23.89 
 
 
477 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  29.29 
 
 
496 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  23.29 
 
 
502 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  28.25 
 
 
930 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  28.74 
 
 
476 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  27.45 
 
 
474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  27.15 
 
 
479 aa  131  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  28.24 
 
 
471 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  26.04 
 
 
945 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  29.05 
 
 
496 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  28.92 
 
 
952 aa  130  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  28.13 
 
 
494 aa  129  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  29.02 
 
 
495 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  28.43 
 
 
497 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  28.41 
 
 
949 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4248  peptidase M16 domain protein  27.66 
 
 
426 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3947  peptidase M16 domain-containing protein  31.46 
 
 
448 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530134  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  27.09 
 
 
436 aa  127  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  30.61 
 
 
949 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  28.68 
 
 
496 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  26.78 
 
 
486 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  28.81 
 
 
495 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  29.91 
 
 
947 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  30.32 
 
 
929 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  22.9 
 
 
483 aa  124  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1801  peptidase M16 domain-containing protein  26.74 
 
 
453 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.36256  normal  0.940688 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  26.59 
 
 
457 aa  123  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0200  peptidase M16 domain protein  28.68 
 
 
412 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  29.55 
 
 
959 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  26.1 
 
 
454 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  27.88 
 
 
446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0678  peptidase M16 domain protein  26.55 
 
 
490 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  28.84 
 
 
438 aa  121  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  31.04 
 
 
519 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  28.78 
 
 
429 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  31.25 
 
 
520 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  24.66 
 
 
725 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  25.54 
 
 
449 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0658  peptidase M16 domain protein  26.25 
 
 
490 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3947  peptidase M16 domain-containing protein  24.24 
 
 
481 aa  119  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  25.82 
 
 
495 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1597  peptidase M16 domain-containing protein  25.41 
 
 
466 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832035  normal  0.315453 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2546  peptidase M16  26.35 
 
 
464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.774857  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  23.48 
 
 
969 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1670  peptidase M16-like  27.33 
 
 
471 aa  117  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  30.79 
 
 
520 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  26.39 
 
 
465 aa  116  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0738  peptidase M16 domain-containing protein  25.36 
 
 
506 aa  116  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3323  processing peptidase  28.99 
 
 
441 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390474  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  27.12 
 
 
437 aa  116  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  24.25 
 
 
954 aa  116  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  26.46 
 
 
435 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  26.46 
 
 
435 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  27.87 
 
 
967 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3554  processing peptidase  29.78 
 
 
467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106365  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  21.38 
 
 
482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0405  peptidase M16 domain protein  28.76 
 
 
449 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.445293  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3039  peptidase M16 domain-containing protein  26.89 
 
 
451 aa  114  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0296274  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  24.51 
 
 
956 aa  114  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3518  peptidase M16 domain-containing protein  28.61 
 
 
460 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>