More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3554 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1190  peptidase M16 domain-containing protein  77.04 
 
 		 477 aa  703    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0547363  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3554  processing peptidase  100 
 
 		 467 aa  930    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106365  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  57.68 
 
 		 435 aa  500  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2133  peptidase M16 domain protein  58.53 
 
 		 436 aa  488  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.765752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3323  processing peptidase  59.95 
 
 		 441 aa  491  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390474  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1507  peptidase M16 domain-containing protein  60.42 
 
 		 451 aa  486  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.583967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7875  processing peptidase  56.94 
 
 		 439 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1340  peptidase M16 domain-containing protein  52.16 
 
 		 462 aa  463  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  55.29 
 
 		 438 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3953  peptidase M16 domain protein  53.63 
 
 		 459 aa  458  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870658  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1382  peptidase M16 domain-containing protein  54.69 
 
 		 466 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.975318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3176  peptidase M16 domain-containing protein  56.72 
 
 		 453 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2477  peptidase M16 domain protein  55.29 
 
 		 445 aa  438  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424609  normal  0.386088 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0785  mitochondrial processing peptidase  54.46 
 
 		 462 aa  430  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.346548  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3582  peptidase M16 domain protein  54.96 
 
 		 444 aa  429  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2147  peptidase M16 domain-containing protein  50.36 
 
 		 429 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5822  peptidase M16 domain protein  53.9 
 
 		 461 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2084  peptidase M16 domain-containing protein  50.36 
 
 		 429 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2101  peptidase M16-like protein  50.36 
 
 		 429 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0527778  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1218  peptidase M16 domain protein  51.25 
 
 		 442 aa  412  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.37886  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1467  peptidase M16 domain protein  50.11 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2351  peptidase M16 domain-containing protein  50.61 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472755 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1026  processing peptidase  52.59 
 
 		 439 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23370  predicted Zn-dependent peptidase  49.89 
 
 		 441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0226628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14700  predicted Zn-dependent peptidase  50.48 
 
 		 453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.2427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4022  peptidase M16 domain-containing protein  50.12 
 
 		 424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0571342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1739  peptidase M16 domain protein  51.32 
 
 		 443 aa  402  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1519  peptidase M16 domain protein  51.72 
 
 		 441 aa  401  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1435  peptidase M16 domain-containing protein  49.07 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12795  zinc protease pepR  48.89 
 
 		 438 aa  389  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1440  peptidase M16 domain protein  48.38 
 
 		 447 aa  385  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2222  peptidase M16 domain protein  49.76 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000128075  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  44.04 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  47.56 
 
 		 418 aa  361  1e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1947  peptidase M16 domain-containing protein  44.53 
 
 		 422 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141516  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07110  predicted Zn-dependent peptidase  49.74 
 
 		 439 aa  356  5e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.54818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  42.82 
 
 		 422 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  42.22 
 
 		 413 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10390  predicted Zn-dependent peptidase  47.88 
 
 		 446 aa  353  4e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0193865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2056  peptidase M16 domain protein  42.75 
 
 		 413 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  43.1 
 
 		 420 aa  348  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  43.55 
 
 		 421 aa  347  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1706  peptidase M16 domain protein  41.06 
 
 		 411 aa  345  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.425033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3627  peptidase M16 domain-containing protein  41.03 
 
 		 413 aa  339  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  38.9 
 
 		 417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  40.54 
 
 		 413 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  40.54 
 
 		 413 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  40.54 
 
 		 413 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  40.54 
 
 		 413 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  40.54 
 
 		 413 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  40.54 
 
 		 413 aa  336  5e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  40.29 
 
 		 413 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  40.29 
 
 		 412 aa  336  7e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  40.54 
 
 		 413 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1315  peptidase M16 domain protein  42.89 
 
 		 418 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0419  peptidase M16-like protein  40.45 
 
 		 419 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1341  zinc protease, insulinase family  41.12 
 
 		 399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.411991 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1419  processing peptidase  36.45 
 
 		 424 aa  322  9.000000000000001e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1309  peptidase M16 domain protein  41.73 
 
 		 418 aa  318  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00910612  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2975  peptidase M16 domain protein  41.23 
 
 		 418 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000177641 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1568  peptidase M16-like  38.46 
 
 		 425 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000011969  decreased coverage  0.00224891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1594  M16 family peptidase  38.81 
 
 		 418 aa  315  8e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.326709  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1907  peptidase M16 domain-containing protein  39.01 
 
 		 419 aa  312  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0978353  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1839  processing peptidase  39.12 
 
 		 432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0910  processing peptidase  38.85 
 
 		 422 aa  308  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1592  peptidase M16-like  40.05 
 
 		 418 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0267121  normal  0.0196738 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1444  processing peptidase  40.29 
 
 		 421 aa  305  8.000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3233  peptidase M16 domain protein  42.02 
 
 		 426 aa  305  8.000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1562  Zn-dependent peptidase  37.89 
 
 		 419 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000390885  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1235  processing peptidase  39.76 
 
 		 418 aa  301  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  40.05 
 
 		 422 aa  300  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2117  processing peptidase  39.4 
 
 		 429 aa  300  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0309  processing peptidase  42.4 
 
 		 421 aa  298  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0115276 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1786  processing peptidase  41.43 
 
 		 421 aa  293  5e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.41523  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0721  peptidase M16 domain-containing protein  39.37 
 
 		 421 aa  292  7e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3234  processing peptidase  40.19 
 
 		 421 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0397  peptidase M16 domain-containing protein  40.73 
 
 		 431 aa  289  9e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4577  peptidase M16-like  38.02 
 
 		 429 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0823  peptidase M16-like  38.79 
 
 		 429 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0678  peptidase M16 domain-containing protein  41.12 
 
 		 424 aa  286  5.999999999999999e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.614007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1147  processing peptidase  39.4 
 
 		 426 aa  285  9e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2340  processing peptidase  41.16 
 
 		 431 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.348853  normal  0.675898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4796  peptidase M16-like  38.35 
 
 		 429 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0908  peptidase M16 domain protein  37.23 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  37.9 
 
 		 423 aa  280  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0263  peptidase M16-like  38.35 
 
 		 429 aa  277  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.736782  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1252  peptidase M16 domain protein  38.26 
 
 		 421 aa  276  6e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0230  peptidase M16  38.71 
 
 		 429 aa  275  9e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0269  peptidase M16 domain protein  41.42 
 
 		 431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  34.3 
 
 		 423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1637  processing peptidase  32.04 
 
 		 418 aa  270  4e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1147  peptidase M16 domain-containing protein  38.98 
 
 		 431 aa  269  7e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3449  processing peptidase  40.2 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3253  processing peptidase  40.25 
 
 		 431 aa  266  5e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3577  processing peptidase  40.25 
 
 		 431 aa  266  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0840  putative zinc protease  36.91 
 
 		 429 aa  266  8.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0535  processing peptidase  36.98 
 
 		 434 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0235  M16 family peptidase  33.25 
 
 		 421 aa  263  4e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1419  peptidase M16-like protein  39.86 
 
 		 420 aa  261  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0503674  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0481  processing peptidase  35.87 
 
 		 419 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130826  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>