More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3741 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  42.91 
 
 
2224 aa  1423    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  35.63 
 
 
2087 aa  1019    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.7 
 
 
2099 aa  680    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.74 
 
 
2113 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3741  Protein of unknown function DUF1998  100 
 
 
2124 aa  4274    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.42 
 
 
2213 aa  647    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  54.82 
 
 
2125 aa  2168    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  36.82 
 
 
2082 aa  1075    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.54 
 
 
2136 aa  460  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  28.7 
 
 
2113 aa  452  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.63 
 
 
2113 aa  452  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.63 
 
 
2113 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.86 
 
 
1764 aa  254  2e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.64 
 
 
1607 aa  156  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  32.38 
 
 
2093 aa  155  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.97 
 
 
1602 aa  152  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.6 
 
 
1589 aa  151  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1543  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.07 
 
 
1711 aa  148  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.26 
 
 
1525 aa  145  9e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.36 
 
 
1672 aa  140  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.09 
 
 
1770 aa  137  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0806  DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.67 
 
 
1543 aa  137  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.67 
 
 
1543 aa  137  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.301369 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  28.65 
 
 
1578 aa  136  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.4 
 
 
1542 aa  135  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.42 
 
 
1695 aa  135  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.05 
 
 
1743 aa  132  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3296  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.61 
 
 
1734 aa  132  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.51 
 
 
2104 aa  131  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0223  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.36 
 
 
1711 aa  131  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.229884  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  35.74 
 
 
1561 aa  131  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  36.93 
 
 
2104 aa  130  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.93 
 
 
2104 aa  130  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.43 
 
 
1741 aa  130  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.232543 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0274  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.27 
 
 
1754 aa  127  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  38.4 
 
 
1838 aa  126  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.9 
 
 
1725 aa  125  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46826  normal  0.102614 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2665  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.35 
 
 
1698 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  36.56 
 
 
1704 aa  124  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0742  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.09 
 
 
1861 aa  124  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2038  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.69 
 
 
2120 aa  123  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.104871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.26 
 
 
1723 aa  122  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4093  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.4 
 
 
685 aa  120  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317776  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0833  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.05 
 
 
1765 aa  120  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.888983 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  35.56 
 
 
2106 aa  117  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.64 
 
 
1722 aa  117  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.32 
 
 
1723 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.43 
 
 
2104 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1302  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.18 
 
 
1719 aa  111  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  31.64 
 
 
1784 aa  105  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.43 
 
 
1759 aa  92.8  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
751 aa  88.6  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.65 
 
 
744 aa  87  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.04 
 
 
959 aa  85.1  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.2 
 
 
744 aa  85.1  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1686  Protein of unknown function DUF1998  29.29 
 
 
931 aa  84.7  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.57 
 
 
803 aa  82.8  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  35.05 
 
 
797 aa  82  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.73 
 
 
744 aa  80.5  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.05 
 
 
1053 aa  80.9  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10757  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10820)  30 
 
 
1210 aa  80.1  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0139643  normal  0.823621 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.99 
 
 
685 aa  80.5  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.14 
 
 
751 aa  80.1  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.17 
 
 
1198 aa  79  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  34.84 
 
 
986 aa  77.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.27 
 
 
972 aa  77.4  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.14 
 
 
808 aa  77  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.11 
 
 
790 aa  76.6  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.21 
 
 
744 aa  76.6  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.48 
 
 
807 aa  75.5  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2842  DEAD/DEAH box helicase-like  46.22 
 
 
321 aa  75.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.567167 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62134  predicted protein  30.77 
 
 
1178 aa  75.1  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5321  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.52 
 
 
764 aa  74.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0653251  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.18 
 
 
962 aa  74.3  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
1086 aa  73.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03333  ATP-dependent RNA helicase  32.04 
 
 
831 aa  73.9  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0123  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.97 
 
 
761 aa  73.2  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0336832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1964  helicase domain protein  24.86 
 
 
1780 aa  73.6  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.285846  normal  0.0141604 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0080  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.77 
 
 
829 aa  73.2  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.412671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0518  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.58 
 
 
763 aa  73.2  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  30.77 
 
 
912 aa  72.4  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  29.75 
 
 
758 aa  72.4  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.73 
 
 
758 aa  72.4  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0302  putative helicase  27.61 
 
 
1878 aa  72.4  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2730  DEAD/DEAH box helicase-like  31.78 
 
 
751 aa  72  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6026  hypothetical protein  36.3 
 
 
148 aa  72.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.05 
 
 
764 aa  71.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.29 
 
 
815 aa  70.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.69 
 
 
768 aa  71.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0733  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.48 
 
 
805 aa  70.5  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48177  predicted protein  34.43 
 
 
1321 aa  70.5  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.32 
 
 
756 aa  70.5  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.87 
 
 
739 aa  70.1  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2271  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.32 
 
 
789 aa  69.7  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.11 
 
 
752 aa  69.3  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0313  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
815 aa  69.3  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.21 
 
 
736 aa  68.9  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2218  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
861 aa  68.9  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.344745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4033  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.58 
 
 
802 aa  68.6  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338213  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2983  Protein of unknown function DUF1998  26 
 
 
948 aa  67.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>