More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1713 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 219 aa  427  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  45.75 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3959  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 219 aa  157  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.426708  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  43.33 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  37.85 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 262 aa  92  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  35.74 
 
 		 224 aa  92  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 		 223 aa  91.7  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 254 aa  89.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 223 aa  89  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 235 aa  89  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  37.33 
 
 		 238 aa  88.2  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1979  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 		 220 aa  86.3  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.053401  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 		 249 aa  86.3  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 250 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 267 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4590  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6983  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 243 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  32.57 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4133  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 231 aa  85.1  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 243 aa  85.1  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 250 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 243 aa  84.7  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  42 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4314  transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0394  transcriptional regulator, GntR family  32.87 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.143272  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.18 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 396 aa  82.8  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  33.83 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  37.88 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  32.87 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1653  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  33.92 
 
 		 244 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  37.16 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  48.31 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4322  transcriptional regulator, GntR family  34.56 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  35.41 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  39.22 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1174  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5155  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 273 aa  78.2  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  23.67 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3676  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  31.11 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3411  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397943  normal  0.632381 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  31.6 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2481  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  33.12 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>