More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1053 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 253 aa  507  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.355972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.94 
 
 		 253 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1452  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.44 
 
 		 259 aa  351  8e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.94 
 
 		 252 aa  325  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.33 
 
 		 251 aa  318  6e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102183 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.97 
 
 		 256 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.32 
 
 		 253 aa  314  9e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.11 
 
 		 255 aa  313  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.35 
 
 		 254 aa  310  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.92 
 
 		 251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.73 
 
 		 250 aa  295  5e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.48 
 
 		 259 aa  292  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1730  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  62.4 
 
 		 256 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.55 
 
 		 251 aa  285  5.999999999999999e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.71 
 
 		 254 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.65 
 
 		 256 aa  282  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.26 
 
 		 255 aa  280  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1990  oxidoreductase  55.12 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.33 
 
 		 254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.73 
 
 		 252 aa  273  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.26 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.44 
 
 		 254 aa  268  8e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.18 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 		 253 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 		 253 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.02 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.66 
 
 		 251 aa  255  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.33 
 
 		 253 aa  255  6e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.27 
 
 		 269 aa  251  6e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167231  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.44 
 
 		 252 aa  251  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.27 
 
 		 269 aa  251  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  50.4 
 
 		 252 aa  249  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.02 
 
 		 250 aa  248  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.58 
 
 		 194 aa  248  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000473762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.6 
 
 		 263 aa  247  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.29 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.88 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.29 
 
 		 253 aa  246  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.45 
 
 		 275 aa  244  6.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3073  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  50 
 
 		 252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175378  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.4 
 
 		 252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.21 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.76 
 
 		 254 aa  243  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.18 
 
 		 250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.79 
 
 		 247 aa  221  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000552143 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32440  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  47.56 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.58 
 
 		 277 aa  202  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.71 
 
 		 248 aa  198  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.71 
 
 		 248 aa  198  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.71 
 
 		 248 aa  198  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 		 263 aa  176  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  40.41 
 
 		 254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 		 262 aa  171  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  39.59 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 		 254 aa  168  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 		 254 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  38.37 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.86 
 
 		 254 aa  165  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 253 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  37.05 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 		 252 aa  155  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  37.05 
 
 		 252 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  36.69 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  36.69 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 246 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1224  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  38 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0621066  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  37.65 
 
 		 248 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 		 257 aa  148  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.293604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.997672 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1961  putative glucose 1-dehydrogenase  36.03 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.536357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>