248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2819 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2819  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 301 aa  600  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  68.8 
 
 		 275 aa  350  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.219886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2946  condensin subunit ScpA  69.77 
 
 		 275 aa  349  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0970123  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2931  condensin subunit ScpA  69.77 
 
 		 275 aa  349  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2975  condensin subunit ScpA  69.77 
 
 		 275 aa  349  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2373  chromosome segregation and condensation protein ScpA  65.44 
 
 		 295 aa  340  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11724  hypothetical protein  68.65 
 
 		 278 aa  338  8e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.295485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3278  chromosome segregation and condensation protein ScpA  69.64 
 
 		 274 aa  323  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25350  condensin subunit ScpA  66.01 
 
 		 289 aa  315  7e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.65 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1491  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.11 
 
 		 289 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.400172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4056  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.47 
 
 		 291 aa  268  8e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2832  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.61 
 
 		 312 aa  265  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0391082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.89 
 
 		 310 aa  264  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0991582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  55.38 
 
 		 274 aa  259  6e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2495  condensin subunit ScpA  55.3 
 
 		 309 aa  257  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.24 
 
 		 359 aa  256  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3122  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.2 
 
 		 293 aa  255  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129768  hitchhiker  0.00203337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1917  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.1 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.536791  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.44 
 
 		 338 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2991  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.76 
 
 		 268 aa  248  9e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2994  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.73 
 
 		 283 aa  245  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1238  condensin subunit ScpA  48.38 
 
 		 275 aa  242  7e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0974  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.69 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1532  condensin subunit ScpA  54.44 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0065622  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19900  condensin subunit ScpA  55.25 
 
 		 342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1532  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.45 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000075545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5063  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.17 
 
 		 354 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0369754  normal  0.0383606 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2155  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.94 
 
 		 303 aa  219  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1452  condensin subunit ScpA  51.43 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15210  hypothetical protein  46.09 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0264564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1930  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.26 
 
 		 322 aa  202  7e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1562  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.1 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1268  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.74 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0238  hypothetical protein  32.99 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  32.54 
 
 		 259 aa  124  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  33.2 
 
 		 247 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  28.69 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  32.93 
 
 		 247 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  32.93 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  32.93 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  32.93 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  32.93 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  32.93 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  32.93 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  28.28 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  32.14 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  32.14 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  31.15 
 
 		 248 aa  106  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  29.02 
 
 		 262 aa  106  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.06 
 
 		 240 aa  105  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.27 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.43 
 
 		 263 aa  105  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07170  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.22 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000172776  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  27.31 
 
 		 264 aa  102  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  32.51 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.12 
 
 		 303 aa  98.2  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.51 
 
 		 236 aa  92.4  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  30.47 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1398  segregation and condensation protein A  29.88 
 
 		 242 aa  91.3  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.331498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25 
 
 		 243 aa  90.9  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.97 
 
 		 267 aa  90.1  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.35 
 
 		 251 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0873  hypothetical protein  26.42 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0366031  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.74 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4345  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.54 
 
 		 254 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.331059 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  30.24 
 
 		 254 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.83 
 
 		 242 aa  85.9  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.72 
 
 		 273 aa  85.9  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0384  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.41 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.268591 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.84 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.86 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  31.4 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.89 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.1 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2190  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.5 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.74 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  30.95 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  30.83 
 
 		 254 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1464  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.96 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.38 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  29.96 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.17 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0097  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.08 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0377485  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.94 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0093  putative segregation and condensation protein A  26.19 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1223  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.91 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0979835  normal  0.2931 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.34 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  29.71 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  27.09 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.09 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.57 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.6 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  28.33 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.2 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376675  decreased coverage  0.00403881 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.3 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  28.46 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.16 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.16 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  27.4 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>