More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2226 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2226  aminotransferase class-III  100 
 
 		 414 aa  827    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.398866  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4579  aminotransferase class-III  70.52 
 
 		 408 aa  567  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1812  aminotransferase class-III  67.81 
 
 		 417 aa  558  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5404  aminotransferase class-III  48.41 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254649  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3064  aminotransferase class-III  45.67 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2295  aminotransferase class-III  46.95 
 
 		 422 aa  339  5.9999999999999996e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.184359 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1190  aminotransferase class-III  44.94 
 
 		 417 aa  335  7e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.429326  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2631  aminotransferase class-III  45.08 
 
 		 424 aa  333  3e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.445972  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  38.39 
 
 		 460 aa  279  5e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  37.82 
 
 		 471 aa  279  5e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  37.93 
 
 		 466 aa  279  8e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  37.99 
 
 		 454 aa  276  6e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  37.8 
 
 		 443 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  36.73 
 
 		 451 aa  273  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6646  putative aminotransferase  38.81 
 
 		 463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349002  normal  0.0868524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  37.53 
 
 		 452 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  37.3 
 
 		 452 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  38.13 
 
 		 479 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  37.39 
 
 		 470 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3718  hypothetical protein  36.93 
 
 		 470 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319896  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  36.96 
 
 		 448 aa  270  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  37.73 
 
 		 455 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  36.69 
 
 		 468 aa  269  5.9999999999999995e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  38.93 
 
 		 478 aa  269  7e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2046  hypothetical protein  36.93 
 
 		 470 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.990392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  35.51 
 
 		 458 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  37.06 
 
 		 452 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2989  putative aminotransferase  38.22 
 
 		 475 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2381  putative aminotransferase  38.43 
 
 		 480 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3014  putative aminotransferase  38.43 
 
 		 480 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.672031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2995  putative aminotransferase  38.43 
 
 		 480 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  38.57 
 
 		 457 aa  266  7e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2904  putative aminotransferase  38.65 
 
 		 477 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  37.18 
 
 		 457 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  38.88 
 
 		 461 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3042  putative aminotransferase  38.43 
 
 		 477 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6344  putative aminotransferase  38.2 
 
 		 480 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1947  putative aminotransferase  37.81 
 
 		 477 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.769855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1829  putative aminotransferase  37.81 
 
 		 476 aa  265  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  37.84 
 
 		 460 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  37.67 
 
 		 453 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2180  putative aminotransferase  38.2 
 
 		 464 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.930783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  36.79 
 
 		 457 aa  263  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  38.65 
 
 		 461 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5915  putative aminotransferase  38.43 
 
 		 464 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2162  putative aminotransferase  38.43 
 
 		 464 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  36.45 
 
 		 459 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  37.3 
 
 		 456 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  37.93 
 
 		 464 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0635  putative aminotransferase  37.81 
 
 		 472 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  38.24 
 
 		 465 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  37.3 
 
 		 456 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  37.04 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2787  putative aminotransferase  37.58 
 
 		 475 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2021  putative aminotransferase  37.58 
 
 		 472 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2710  putative aminotransferase  37.58 
 
 		 475 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  37.81 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  36.49 
 
 		 460 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2653  putative aminotransferase  37.58 
 
 		 472 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  37.59 
 
 		 453 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  37.5 
 
 		 453 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0727  putative aminotransferase  37.33 
 
 		 472 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2100  aminotransferase class-III  39.13 
 
 		 461 aa  259  7e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  37.35 
 
 		 453 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  37.41 
 
 		 456 aa  259  8e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  37.67 
 
 		 451 aa  259  8e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  37.56 
 
 		 455 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  37.84 
 
 		 462 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  37.44 
 
 		 454 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  37.27 
 
 		 461 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3573  putative aminotransferase  36.94 
 
 		 478 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.67707 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  37.27 
 
 		 461 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  37.27 
 
 		 461 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0307  putative aminotransferase  37.59 
 
 		 460 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  37.5 
 
 		 461 aa  256  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4932  putative aminotransferase  37.33 
 
 		 456 aa  255  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0208  beta alanine--pyruvate transaminase  37.2 
 
 		 448 aa  255  9e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42346  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  37.22 
 
 		 460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  35.6 
 
 		 462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2871  putative aminotransferase  37.05 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59328  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  35.67 
 
 		 463 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5472  putative aminotransferase  37.08 
 
 		 461 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  35.73 
 
 		 454 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  36.7 
 
 		 455 aa  253  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01620  beta alanine--pyruvate transaminase  36.97 
 
 		 448 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.870512 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  37.24 
 
 		 458 aa  252  7e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  35.83 
 
 		 456 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  36.57 
 
 		 448 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  36.18 
 
 		 464 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  36.65 
 
 		 458 aa  251  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  35.47 
 
 		 459 aa  251  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6089  omega amino acid--pyruvate transaminase  38.48 
 
 		 444 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1493  aminotransferase class-III  37.56 
 
 		 458 aa  250  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4665  putative aminotransferase  35.96 
 
 		 482 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63500  hypothetical protein  36.61 
 
 		 468 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.711266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  35.54 
 
 		 456 aa  249  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5629  hypothetical protein  36.17 
 
 		 467 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  33.94 
 
 		 470 aa  248  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0941  putative aminotransferase  35.73 
 
 		 481 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140903  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  36.79 
 
 		 451 aa  246  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>