171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3175 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  100 
 
 		 1485 aa  2909    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  90.44 
 
 		 1485 aa  2545    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  46.16 
 
 		 1377 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  45.41 
 
 		 1325 aa  555  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  36.63 
 
 		 1308 aa  386  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  30.4 
 
 		 1184 aa  218  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  30.4 
 
 		 1184 aa  218  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1352 aa  198  6e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  31.18 
 
 		 1262 aa  197  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  30.19 
 
 		 1283 aa  167  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  29.22 
 
 		 1382 aa  164  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1224 aa  162  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1206 aa  160  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  29.87 
 
 		 1224 aa  159  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1224 aa  158  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  29.13 
 
 		 1223 aa  155  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  31.93 
 
 		 1243 aa  155  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1226 aa  147  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1218 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  30.07 
 
 		 1056 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1174 aa  142  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1229 aa  142  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  25.59 
 
 		 929 aa  142  7e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  25.8 
 
 		 929 aa  141  8.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1259 aa  139  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  26.56 
 
 		 1285 aa  139  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1259 aa  138  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1259 aa  138  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1259 aa  138  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1259 aa  138  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1259 aa  137  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1226 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1259 aa  136  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  23.62 
 
 		 1249 aa  136  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  29.64 
 
 		 1359 aa  135  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1259 aa  135  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  23.41 
 
 		 1246 aa  135  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1259 aa  135  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  24.32 
 
 		 1259 aa  135  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  24.32 
 
 		 857 aa  135  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1259 aa  134  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  28.02 
 
 		 1401 aa  134  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1259 aa  134  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1221 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1221 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1259 aa  134  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  26.42 
 
 		 1285 aa  133  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1340 aa  133  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  27.29 
 
 		 1273 aa  132  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  27.29 
 
 		 1273 aa  132  6e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1305 aa  130  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  28.11 
 
 		 1304 aa  130  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  23.61 
 
 		 1342 aa  129  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1291 aa  129  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1312 aa  130  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  23.49 
 
 		 1256 aa  129  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1255 aa  128  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  24.39 
 
 		 1254 aa  128  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1258 aa  127  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1265 aa  127  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1232 aa  126  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1473 aa  125  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1319 aa  125  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  27.71 
 
 		 1299 aa  125  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  27.42 
 
 		 1304 aa  125  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  29.42 
 
 		 1443 aa  125  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1392 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1372 aa  123  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1290 aa  123  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1372 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1372 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1372 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1372 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1372 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1372 aa  121  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1290 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  26.65 
 
 		 1453 aa  120  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1292 aa  119  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1434 aa  119  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  28.25 
 
 		 1426 aa  119  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1254 aa  119  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  25 
 
 		 1346 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1375 aa  115  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1380 aa  115  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  28.15 
 
 		 1346 aa  114  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  26.63 
 
 		 1378 aa  114  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1259 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  25.97 
 
 		 1025 aa  112  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2443  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1347 aa  111  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1827  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1347 aa  111  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1347 aa  111  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1319 aa  110  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1361 aa  108  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  23.87 
 
 		 846 aa  108  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1448 aa  108  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1360 aa  107  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1358 aa  107  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1310 aa  106  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5769  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1360 aa  106  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0973726  normal  0.232191 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  24.95 
 
 		 1443 aa  106  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>