More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2288 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2288  sensor histidine kinase  100 
 
 		 520 aa  1048    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0881  sensor histidine kinase  40.93 
 
 		 524 aa  360  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2737  histidine kinase  40.21 
 
 		 523 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  43.73 
 
 		 583 aa  259  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.64 
 
 		 483 aa  251  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.18 
 
 		 604 aa  251  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2297  sensory box histidine kinase  46.72 
 
 		 762 aa  240  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2567  two component sensor histidine kinase  40.23 
 
 		 526 aa  240  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.64 
 
 		 517 aa  240  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  48.5 
 
 		 733 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 730 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0059666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.43 
 
 		 591 aa  239  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.24 
 
 		 396 aa  239  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0255  sensory box histidine kinase  44.04 
 
 		 616 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  48.77 
 
 		 499 aa  237  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.63 
 
 		 738 aa  238  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.84 
 
 		 779 aa  237  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  39.6 
 
 		 496 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.2 
 
 		 1224 aa  236  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 857 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1286  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.39 
 
 		 859 aa  233  9e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.47 
 
 		 536 aa  232  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2762  histidine kinase  49 
 
 		 558 aa  230  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2571  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 406 aa  230  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1642  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.58 
 
 		 406 aa  229  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.905013  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2444  sensor histidine kinase  46.48 
 
 		 610 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.119384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.74 
 
 		 616 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.459436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 778 aa  227  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 618 aa  226  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.5 
 
 		 556 aa  226  8e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0875  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.11 
 
 		 368 aa  225  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021337 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.76 
 
 		 1354 aa  224  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1741  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 857 aa  224  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.99373 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.08 
 
 		 519 aa  224  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.71 
 
 		 604 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1756  PAS sensor signal transduction histidine kinase  46.31 
 
 		 718 aa  223  6e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.977279  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0103  sensory box histidine kinase  43.77 
 
 		 703 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0011  histidine kinase  49.34 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  48.56 
 
 		 749 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0010  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.7 
 
 		 363 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3455  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.22 
 
 		 472 aa  220  5e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 		 510 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  45.9 
 
 		 770 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 493 aa  219  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.32 
 
 		 578 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.87 
 
 		 775 aa  217  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0875  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 628 aa  217  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1036  sensor histidine kinase  43.27 
 
 		 579 aa  216  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.696907  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 486 aa  216  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.54 
 
 		 915 aa  216  9e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5638  histidine kinase  47.01 
 
 		 540 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2669  sensor histidine kinase  43.95 
 
 		 343 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 1003 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2667  sensory box histidine kinase  43.12 
 
 		 498 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2845  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 		 545 aa  210  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000115656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.07 
 
 		 572 aa  210  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2565  sensor histidine kinase  44.12 
 
 		 255 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1313  histidine kinase  36.81 
 
 		 501 aa  209  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0237175  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.34 
 
 		 591 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  45.85 
 
 		 533 aa  208  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0103  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.05 
 
 		 639 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1050  sensory box histidine kinase  44.44 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 		 547 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0504248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2384  sensor histidine kinase  47.74 
 
 		 614 aa  207  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0302  histidine kinase  49.53 
 
 		 584 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3148  sensor histidine kinase  45.57 
 
 		 671 aa  207  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 479 aa  205  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0408317  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0475  sensory box histidine kinase  40.72 
 
 		 622 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 		 636 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0693  sensory box histidine kinase  43.85 
 
 		 602 aa  204  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.958566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  37.34 
 
 		 604 aa  204  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2790  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.53 
 
 		 463 aa  204  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0541  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.39 
 
 		 587 aa  203  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000947824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0822  sensory box histidine kinase  41.98 
 
 		 729 aa  203  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 		 810 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0852026  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 		 904 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 		 798 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0947899999999999e-22 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1121  histidine kinase  38.51 
 
 		 307 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3141  histidine kinase  42.34 
 
 		 307 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.91 
 
 		 1562 aa  201  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2098  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 547 aa  199  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000413163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4421  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.12 
 
 		 457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 		 547 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  37.41 
 
 		 767 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 502 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0749  sensory box histidine kinase  40.71 
 
 		 597 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173426  normal  0.0355967 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2712  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.65 
 
 		 414 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 		 845 aa  197  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 517 aa  196  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 807 aa  197  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.309689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 1177 aa  196  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 394 aa  196  9e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 		 639 aa  195  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1368  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 		 551 aa  194  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126937 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 		 458 aa  193  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2990  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.91 
 
 		 1253 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450084  normal  0.707823 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2070  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 		 645 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000789609 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0919  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 		 559 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.4473e-32 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  43.75 
 
 		 794 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 		 355 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>