More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1220 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1220  response regulator  100 
 
 		 277 aa  554  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  77.62 
 
 		 277 aa  448  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  61.31 
 
 		 275 aa  364  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  51.99 
 
 		 340 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3127  response regulator receiver protein  53.14 
 
 		 283 aa  297  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1135  response regulator receiver protein  52.03 
 
 		 283 aa  293  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0978  response regulator receiver protein  44.73 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000299391  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2281  response regulator receiver protein  39.27 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.217898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1942  response regulator receiver protein  39.27 
 
 		 280 aa  226  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2813  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 274 aa  198  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2262  response regulator receiver protein  36.03 
 
 		 281 aa  198  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1797  response regulator receiver protein  38.2 
 
 		 292 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0698667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2420  response regulator receiver protein  37.45 
 
 		 292 aa  192  7e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  37.32 
 
 		 553 aa  99.8  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  41.74 
 
 		 229 aa  99.4  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  35.62 
 
 		 554 aa  99  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  41.01 
 
 		 553 aa  98.2  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 242 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  38.58 
 
 		 242 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1134  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 138 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461969  hitchhiker  0.00297359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3458  response regulator receiver  40.16 
 
 		 365 aa  95.9  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1228  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.8 
 
 		 349 aa  95.9  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 1426 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1095  response regulator receiver domain-containing protein  35.54 
 
 		 138 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117755  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1870  response regulator receiver modulated serine phosphatase  38.66 
 
 		 379 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.177859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1223  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 132 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1155  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 132 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1844  response regulator receiver modulated serine phosphatase  38.66 
 
 		 379 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  43.24 
 
 		 125 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 523 aa  93.6  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.17 
 
 		 231 aa  93.6  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 123 aa  93.6  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  33.96 
 
 		 1388 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1566  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  40.65 
 
 		 396 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  38.02 
 
 		 1427 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 231 aa  92.4  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  40.35 
 
 		 242 aa  92.4  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  36.51 
 
 		 242 aa  92.8  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.1 
 
 		 310 aa  92.4  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  34.92 
 
 		 242 aa  92.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  34.92 
 
 		 242 aa  92  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 123 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  36.97 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 123 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 242 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  36.67 
 
 		 123 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  35 
 
 		 2301 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  40 
 
 		 553 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 373 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 		 122 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  37.29 
 
 		 124 aa  90.9  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 123 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  38.05 
 
 		 121 aa  90.5  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  39.05 
 
 		 128 aa  90.1  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 230 aa  90.5  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 231 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 229 aa  89.7  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  34.35 
 
 		 356 aa  89.7  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0921  response regulator receiver modulated serine phosphatase  39.5 
 
 		 378 aa  90.1  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  37.69 
 
 		 326 aa  89.7  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 236 aa  89.7  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  38.6 
 
 		 457 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  39.13 
 
 		 237 aa  89.7  5e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  39.47 
 
 		 235 aa  89.7  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  33.77 
 
 		 1343 aa  89.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.04 
 
 		 563 aa  89.4  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 121 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  37.72 
 
 		 457 aa  89.4  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  35.42 
 
 		 564 aa  89  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.97 
 
 		 380 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 121 aa  89  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 122 aa  89  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2955  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.43 
 
 		 308 aa  89  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 236 aa  89  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  34.67 
 
 		 787 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0828  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.39 
 
 		 324 aa  88.2  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  35.04 
 
 		 121 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 124 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 121 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5910  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 168 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  38.6 
 
 		 122 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3790  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.98 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3274  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 383 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  35.96 
 
 		 457 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.77 
 
 		 392 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  32.63 
 
 		 555 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 452 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0975  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 383 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2062  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 217 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  34.29 
 
 		 564 aa  87.8  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2984  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  33.07 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.43543  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 		 230 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>