87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3642 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3642  Peptidase M23  100 
 
 		 339 aa  689    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3591  peptidase M23B  79.66 
 
 		 302 aa  471  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6259  Peptidase M23  36.68 
 
 		 308 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485379  normal  0.820011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0942  peptidase M23B  28.87 
 
 		 321 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0501696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0711  Peptidase M23  37.93 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324034 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1987  peptidase, M23/M37 family  30.3 
 
 		 286 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.431203  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1958  M24/M37 family peptidase  28.73 
 
 		 286 aa  99  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.186178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1691  cell wall endopeptidase  31.73 
 
 		 286 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1717  cell wall endopeptidase  30.26 
 
 		 286 aa  93.6  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.402348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1914  peptidase, M23/M37 family  29.89 
 
 		 286 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000487 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1742  M24/M37 family peptidase  30.8 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124078  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2536  Peptidase M23  42.52 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1872  peptidase, M23/M37 family  36.24 
 
 		 187 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.917362  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1879  M23/37 family peptidase  34.02 
 
 		 262 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2599  peptidase M23  32.09 
 
 		 251 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3471  peptidase, M23/M37 family  36.3 
 
 		 234 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0239412  hitchhiker  0.000000108931 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1320  hypothetical protein  30.39 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2272  peptidase M23B  35.46 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2233  peptidase M23B  35.46 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467623  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1743  peptidase M23B  38.1 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2837  Peptidase M23  31.45 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000204146  normal  0.0350761 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0268  Peptidase M23  26.42 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.839567 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2463  hypothetical protein  30.51 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2234  peptidase M23B  31.85 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  hitchhiker  0.000684677 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2320  hypothetical protein  32.26 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4198  peptidase M23B  32.16 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.354904 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1462  peptidase M23B  52.73 
 
 		 111 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0490484  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4002  peptidase M23B  44.83 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2205  Peptidase M23  49.09 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000288171  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12860  metalloendopeptidase-like membrane protein  28.98 
 
 		 281 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2926  Peptidase M23  29.6 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.902001  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27670  metalloendopeptidase-like membrane protein  27.78 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1660  peptidase M23B  39.77 
 
 		 348 aa  57  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190766  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0115  Peptidase M23  31.06 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3898  Peptidase M23  32.33 
 
 		 442 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0247447  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0377  Peptidase M23  37.36 
 
 		 409 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2558  peptidase M23B  37.08 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1538  Peptidase M23  25.9 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000553648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3404  Peptidase M23  25.15 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.3 
 
 		 554 aa  50.1  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3592  peptidase M23B  43.55 
 
 		 321 aa  50.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  34.38 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  39.68 
 
 		 414 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  43.55 
 
 		 266 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  36.99 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  30.97 
 
 		 304 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  27.89 
 
 		 995 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  32.99 
 
 		 281 aa  46.6  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  39.68 
 
 		 465 aa  46.6  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1705  Peptidase M23  48.28 
 
 		 360 aa  46.2  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  36.25 
 
 		 283 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  48.28 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  29 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  32.69 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  51.35 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  46 
 
 		 460 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.3 
 
 		 547 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  41.07 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  31.19 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  32.97 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7968  Peptidase M23  37.08 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  33.66 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  34.41 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  32.97 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3052  Peptidase M23  34.57 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.346381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  32.63 
 
 		 340 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  31.18 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2422  peptidase M23B  55.26 
 
 		 475 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  40 
 
 		 334 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  35.48 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  31.46 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  30.48 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  35.48 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  48.98 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  44.9 
 
 		 491 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5572  Peptidase M23  35 
 
 		 253 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  31.48 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  45.71 
 
 		 382 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  52.78 
 
 		 300 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  31.48 
 
 		 299 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  35.79 
 
 		 333 aa  43.1  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  31.46 
 
 		 300 aa  43.1  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  48.89 
 
 		 285 aa  42.7  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  38.33 
 
 		 238 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  37.65 
 
 		 337 aa  42.7  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03923  peptidase M23B  32.67 
 
 		 293 aa  42.7  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0458107  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  35.48 
 
 		 470 aa  42.7  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>