75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3543 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  89.98 
 
 		 958 aa  1733    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  89.56 
 
 		 958 aa  1711    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  87.15 
 
 		 955 aa  1691    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  100 
 
 		 957 aa  1935    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  41.89 
 
 		 1009 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  36.93 
 
 		 1143 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  37.47 
 
 		 1143 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  35.34 
 
 		 1017 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  35.49 
 
 		 1018 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  35.29 
 
 		 1276 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  34.13 
 
 		 902 aa  335  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  35.56 
 
 		 1038 aa  324  6e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  33.6 
 
 		 1017 aa  323  7e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  36.54 
 
 		 1053 aa  321  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  34.02 
 
 		 1046 aa  297  6e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  34.1 
 
 		 1457 aa  287  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  42.21 
 
 		 1106 aa  283  8.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  35.24 
 
 		 1036 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  40.77 
 
 		 1110 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  41.59 
 
 		 1294 aa  267  8e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  38.61 
 
 		 901 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  30.75 
 
 		 1453 aa  241  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  36.3 
 
 		 688 aa  235  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  29.48 
 
 		 1454 aa  232  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  35.92 
 
 		 2222 aa  226  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  27.71 
 
 		 1596 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  32.93 
 
 		 1521 aa  204  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  32.65 
 
 		 1196 aa  198  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  27.92 
 
 		 1916 aa  198  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  31.98 
 
 		 1438 aa  195  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  28.32 
 
 		 1691 aa  194  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  29.64 
 
 		 1672 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  30.59 
 
 		 979 aa  187  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  30.71 
 
 		 1127 aa  181  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  27.39 
 
 		 1281 aa  171  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  30.24 
 
 		 1379 aa  159  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  29.27 
 
 		 869 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  25.86 
 
 		 672 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  28.22 
 
 		 2026 aa  102  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  24.65 
 
 		 1611 aa  95.5  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  25.99 
 
 		 2499 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  26.33 
 
 		 939 aa  66.6  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  26.85 
 
 		 2803 aa  63.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  26.44 
 
 		 1645 aa  61.6  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  24.79 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  24.63 
 
 		 455 aa  60.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  25.37 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  24.53 
 
 		 1525 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  25.5 
 
 		 1848 aa  57  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  30.32 
 
 		 1496 aa  56.6  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  24.77 
 
 		 806 aa  54.7  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1537 aa  53.9  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  23.28 
 
 		 664 aa  54.3  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1289 aa  53.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1538 aa  53.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  23.53 
 
 		 655 aa  51.6  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  24.44 
 
 		 426 aa  51.2  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  23.13 
 
 		 650 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  24.6 
 
 		 656 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  23.1 
 
 		 717 aa  50.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1829  hypothetical protein  26.2 
 
 		 570 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  23.9 
 
 		 655 aa  49.3  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1156  hypothetical protein  31.01 
 
 		 176 aa  47.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  23.68 
 
 		 2912 aa  47.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  25 
 
 		 2081 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  23.76 
 
 		 362 aa  47  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  23.71 
 
 		 711 aa  47  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  22.98 
 
 		 655 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  23.46 
 
 		 658 aa  45.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  23.5 
 
 		 867 aa  45.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6276  cytochrome C family protein  25.25 
 
 		 501 aa  45.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  23.2 
 
 		 650 aa  44.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  26.9 
 
 		 655 aa  44.7  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  24.23 
 
 		 656 aa  44.7  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2762  cytochrome C family protein  24.57 
 
 		 454 aa  44.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>