More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3398 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  100 
 
 		 263 aa  543  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  50.57 
 
 		 279 aa  261  6e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  47.67 
 
 		 270 aa  258  9e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  46.92 
 
 		 273 aa  253  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  49.22 
 
 		 277 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  47.08 
 
 		 265 aa  249  3e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  46.77 
 
 		 271 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  47.31 
 
 		 274 aa  246  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  48.83 
 
 		 282 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  47.53 
 
 		 271 aa  246  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  44.66 
 
 		 272 aa  244  8e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  46.92 
 
 		 274 aa  244  8e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  48.67 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  47.1 
 
 		 273 aa  243  3e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  46.51 
 
 		 272 aa  241  7e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  44.4 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  42.31 
 
 		 288 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  45.53 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  45.14 
 
 		 275 aa  235  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  44.75 
 
 		 282 aa  231  6e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  46.12 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  47.88 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  46.15 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  44.66 
 
 		 279 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  48.84 
 
 		 279 aa  228  6e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  45.74 
 
 		 281 aa  228  7e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  44.11 
 
 		 275 aa  228  9e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  46.12 
 
 		 281 aa  227  1e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  45.35 
 
 		 276 aa  225  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  41.9 
 
 		 269 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  43.13 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  44.14 
 
 		 286 aa  223  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  41.9 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  44.31 
 
 		 284 aa  222  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  42.75 
 
 		 275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  44.31 
 
 		 280 aa  222  6e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  44.14 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  40.32 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  43.85 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  43.68 
 
 		 277 aa  216  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  41.86 
 
 		 274 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  41.86 
 
 		 274 aa  214  9e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  42.53 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  42.37 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  45.19 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  43.36 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  43.98 
 
 		 277 aa  212  5.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  43.18 
 
 		 297 aa  211  7e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  45 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  41.83 
 
 		 277 aa  210  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  42.8 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  42.16 
 
 		 286 aa  209  5e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  40.54 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  39.08 
 
 		 268 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  42.58 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  41.34 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  41.8 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  41.25 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  41.25 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  41.25 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1629  transketolase, N-terminal subunit  44.7 
 
 		 272 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.788603  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2131  transketolase, N-terminal subunit  44.7 
 
 		 274 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.805825  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3183  transketolase, N-terminal subunit  44.7 
 
 		 274 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2516  transketolase domain-containing protein  44.7 
 
 		 274 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499575  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1405  transketolase, N-terminal subunit  44.7 
 
 		 274 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0485519  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2656  transketolase, N-terminal subunit  44.7 
 
 		 311 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.653892  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2569  transketolase domain-containing protein  44.7 
 
 		 274 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.818868  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1962  transketolase, N-terminal subunit  44.7 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5105  Transketolase domain protein  40.7 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  40 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  40.07 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  42.4 
 
 		 278 aa  196  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  47.15 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  40.08 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  41.8 
 
 		 273 aa  195  5.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  44.08 
 
 		 689 aa  195  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  39.54 
 
 		 294 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  40.48 
 
 		 640 aa  187  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  39.59 
 
 		 276 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  41.73 
 
 		 606 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  39.59 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  39.59 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  38.13 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  35.77 
 
 		 555 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0129  UbiC transcription regulator-associated domain protein  40.86 
 
 		 579 aa  182  3e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.625714 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2514  transketolase subunit A  40.31 
 
 		 269 aa  182  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  39.59 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  38.35 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0615  transketolase subunit A  38.76 
 
 		 268 aa  182  7e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  39.18 
 
 		 276 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  38.2 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  37.5 
 
 		 303 aa  178  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  37.96 
 
 		 285 aa  178  8e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  36.19 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  40.23 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1276  Transketolase domain protein  40.98 
 
 		 274 aa  176  3e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2091  transketolase domain-containing protein  36.43 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2366  Transketolase domain protein  36.43 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.95971  normal  0.0469073 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1716  Transketolase domain protein  40.61 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  39.17 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>