156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3080 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3080  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 		 157 aa  325  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  65.71 
 
 		 140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2962  secreted and surface protein  53.57 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154745  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2200  beta-Ig-H3/fasciclin  47.06 
 
 		 141 aa  140  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.474723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2972  secreted and surface protein  42.45 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.143702  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  39.26 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  42.22 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  42.22 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  36.15 
 
 		 134 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  37.04 
 
 		 166 aa  97.1  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  42.86 
 
 		 187 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  42.86 
 
 		 187 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  33.83 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  45.11 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  36.3 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  33.83 
 
 		 187 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  38.52 
 
 		 279 aa  90.5  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  34.62 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1724  beta-Ig-H3/fasciclin  36.03 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  36.36 
 
 		 208 aa  89  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  37.12 
 
 		 201 aa  88.6  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  36.76 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  37.21 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  34.88 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  34.88 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  36.23 
 
 		 133 aa  87.8  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  35.82 
 
 		 160 aa  87  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  37.12 
 
 		 156 aa  87  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  34.69 
 
 		 183 aa  85.1  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  36.36 
 
 		 156 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0542  beta-Ig-H3/fasciclin  35.77 
 
 		 330 aa  84  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  36.84 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  35.37 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1725  beta-Ig-H3/fasciclin  32.84 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  34.78 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  35.29 
 
 		 315 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  33.78 
 
 		 202 aa  80.5  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  34.46 
 
 		 184 aa  80.5  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  35.33 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0949  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  35.29 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  35.82 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  32.88 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  33.11 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  34.23 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  34.23 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  34.56 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  34.62 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  34.75 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  32.84 
 
 		 596 aa  76.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  34.93 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  34.78 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  35.38 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  31.65 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  33.08 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  32.09 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  31.33 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  31.69 
 
 		 308 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  33.09 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  38.97 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  30.53 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  33.33 
 
 		 189 aa  73.9  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  31.54 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  37.12 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  32.14 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  30.56 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  33.33 
 
 		 611 aa  72  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  33.82 
 
 		 261 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  30.88 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  28.99 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  30.61 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  35.09 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  31.21 
 
 		 194 aa  70.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0405  hypothetical protein  34.97 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160979 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  30.61 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0451  beta-Ig-H3/fasciclin  34.97 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.836003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1085  fasciclin domain protein  36 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  29.93 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  31.97 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  31.97 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  29.1 
 
 		 558 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  31.34 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  31.69 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2197  beta-Ig-H3/fasciclin  32.91 
 
 		 346 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1723  beta-Ig-H3/fasciclin  27.82 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1656  beta-Ig-H3/fasciclin  29.14 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  30 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  30.71 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  34.85 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  29.79 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27077  predicted protein  32.84 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259215  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  29.73 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  28.93 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  30.6 
 
 		 215 aa  64.3  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  31.37 
 
 		 185 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3070  beta-Ig-H3/fasciclin  30 
 
 		 354 aa  63.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201984  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1202  beta-Ig-H3/fasciclin  25.84 
 
 		 272 aa  63.9  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.27385  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0114  beta-Ig-H3/fasciclin  33.57 
 
 		 337 aa  63.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.868659  normal  0.166356 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>