280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2276 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  88.89 
 
 		 432 aa  748    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 432 aa  835    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  54.27 
 
 		 437 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  54.29 
 
 		 432 aa  425  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  51.51 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  46.05 
 
 		 434 aa  317  4e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  46.83 
 
 		 428 aa  315  9e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  47.24 
 
 		 435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  31.07 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  31.5 
 
 		 428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  28.85 
 
 		 437 aa  129  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  28.43 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  28.22 
 
 		 437 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  29.22 
 
 		 471 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1549  Outer membrane efflux protein  26.74 
 
 		 426 aa  124  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.069846  normal  0.874867 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  28.3 
 
 		 423 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  28.3 
 
 		 423 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  28.3 
 
 		 423 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  27.55 
 
 		 479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  25.81 
 
 		 423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  28.87 
 
 		 394 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  25.89 
 
 		 423 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.47 
 
 		 493 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  29.37 
 
 		 416 aa  111  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  26.87 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  26.43 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  27.85 
 
 		 431 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0087  outer membrane efflux protein  24.47 
 
 		 424 aa  103  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  26.58 
 
 		 426 aa  100  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  26.01 
 
 		 418 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  27.99 
 
 		 408 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  27.7 
 
 		 438 aa  97.1  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  25.37 
 
 		 421 aa  96.3  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  25.76 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  27.81 
 
 		 458 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  28.86 
 
 		 442 aa  94.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  24.5 
 
 		 446 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  25.92 
 
 		 437 aa  93.6  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  27.79 
 
 		 443 aa  93.2  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2929  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 443 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  26.99 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  27.71 
 
 		 436 aa  92  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1614  outer membrane efflux protein  22.68 
 
 		 409 aa  91.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0829  outer membrane protein; cation efflux protein  24.04 
 
 		 428 aa  90.9  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  27.42 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4313  outer membrane efflux protein  27.03 
 
 		 528 aa  90.9  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  27.02 
 
 		 451 aa  90.9  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  23.83 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  26.47 
 
 		 437 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1958  aconitate hydratase 1  27.59 
 
 		 422 aa  87.4  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0713794  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  26.47 
 
 		 439 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  27.25 
 
 		 443 aa  87  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  27.25 
 
 		 452 aa  87  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  26.47 
 
 		 439 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  27.25 
 
 		 461 aa  86.7  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  27.25 
 
 		 461 aa  86.7  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  28.53 
 
 		 417 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  27.25 
 
 		 461 aa  86.7  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  27.25 
 
 		 461 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0447  outer membrane efflux protein  24.38 
 
 		 438 aa  86.7  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0227  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 		 414 aa  86.3  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  26.19 
 
 		 440 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  25.94 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  26.97 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  27.91 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2843  outer membrane efflux protein  26.42 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  27.91 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1970  outer membrane efflux protein  24.38 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  27.25 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0790  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 		 423 aa  79.7  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  27.15 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  28.72 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  28.09 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2551  outer membrane efflux protein  26.42 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000963739  normal  0.205494 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2096  outer membrane efflux protein  27.03 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  24.73 
 
 		 523 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1343  outer membrane efflux protein  22.86 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6550  outer membrane efflux protein  24.49 
 
 		 433 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  26.43 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  27.86 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2657  outer membrane efflux protein  27.32 
 
 		 466 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4056  outer membrane efflux protein  26.01 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  27.95 
 
 		 433 aa  69.7  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  27.22 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  27.5 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2191  outer membrane efflux protein  28.06 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  26.18 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1293  outer membrane efflux protein  25.96 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.803504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3728  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 433 aa  67  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602217  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 		 453 aa  67  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  23.02 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  23.83 
 
 		 423 aa  67  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3870  Co/Zn/Cd efflux system component  24.04 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0578  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0382538 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  26.78 
 
 		 438 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2262  outer membrane heavy metal efflux protein  25.4 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>