137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6289 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  638    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  40.65 
 
 		 484 aa  162  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  39.94 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  30.04 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  33.56 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  28.06 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  31.91 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  23.68 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.1 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  32.76 
 
 		 322 aa  97.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  25.82 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  32.76 
 
 		 361 aa  93.6  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  31.05 
 
 		 334 aa  92.4  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  28.32 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3212  protein of unknown function DUF201  27.39 
 
 		 322 aa  85.9  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  29.9 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  29.64 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0990  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.61 
 
 		 1056 aa  72.8  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.587496  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19040  carbamoylphosphate synthase large subunit  33.5 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  28.44 
 
 		 430 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5257  protein of unknown function DUF201  28.53 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.44 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  29.58 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  27.97 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1919  hypothetical protein  25 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57396 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5241  hypothetical protein  28.71 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0582778  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0882  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  27.08 
 
 		 1063 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  20.43 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2319  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.3 
 
 		 1056 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  27.69 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0872  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.76 
 
 		 1075 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4016  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.9 
 
 		 1065 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0283  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.49 
 
 		 1053 aa  61.6  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.85267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  22.98 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2374  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.76 
 
 		 1071 aa  59.7  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128175  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0373  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  27.4 
 
 		 1075 aa  59.3  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  21.79 
 
 		 399 aa  59.3  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  23.79 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1900  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.07 
 
 		 1082 aa  57.4  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00662116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.07 
 
 		 1082 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0008  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.83 
 
 		 1080 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3514  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.32 
 
 		 1067 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191871  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0834  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.95 
 
 		 1053 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.249678 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3603  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.32 
 
 		 1067 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1774  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.55 
 
 		 1081 aa  56.2  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000157385  normal  0.0854041 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3672  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.32 
 
 		 1067 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0247546  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1254  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.45 
 
 		 1074 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.179154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2524  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.68 
 
 		 1078 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0237548  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1782  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.4 
 
 		 1054 aa  53.5  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.57 
 
 		 327 aa  53.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2079  biotin carboxylase / acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  24.62 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.252313  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  25.98 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0115  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.48 
 
 		 1056 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0085  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.79 
 
 		 1056 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00260745  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0121  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25 
 
 		 1075 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0613  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.38 
 
 		 1073 aa  51.6  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.438109  normal  0.344128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1672  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.68 
 
 		 1107 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1302  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.43 
 
 		 1082 aa  50.8  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1549  hypothetical protein  27.3 
 
 		 413 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0467  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  25.24 
 
 		 495 aa  50.8  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0534  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  25 
 
 		 495 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.701669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1935  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.35 
 
 		 324 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.23 
 
 		 424 aa  50.4  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3204  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.05 
 
 		 1042 aa  49.7  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610402  normal  0.762296 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0489  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  24.76 
 
 		 495 aa  49.7  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1416  phosphoribosylamine/glycine ligase  25.52 
 
 		 413 aa  49.3  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000507728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2886  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.84 
 
 		 1082 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.827795  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  27.75 
 
 		 366 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1498  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.96 
 
 		 1064 aa  48.9  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0114  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.62 
 
 		 1025 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.440832 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0645  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.86 
 
 		 1081 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.796539 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0628  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.86 
 
 		 1081 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1651  carbamoyl-phosphate synthase, medium subunit  25.81 
 
 		 492 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  31.1 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1712  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.32 
 
 		 1126 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00812238  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  22.22 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1096  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  31.9 
 
 		 1080 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.528087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0661  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25 
 
 		 1066 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00149325  normal  0.138255 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0144  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.54 
 
 		 1025 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0559  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.36 
 
 		 1059 aa  46.6  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0533  carbamoyl phosphate synthase-like protein  22.31 
 
 		 336 aa  46.6  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3153  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25.08 
 
 		 1105 aa  46.6  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184389 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  23.84 
 
 		 439 aa  46.6  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1541  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.45 
 
 		 1077 aa  46.6  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  29.11 
 
 		 415 aa  46.6  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1419  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.92 
 
 		 425 aa  46.2  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0571  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25.7 
 
 		 1094 aa  46.2  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1632  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.17 
 
 		 1095 aa  46.2  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000380  methylcrotonyl-CoA carboxylase biotin-containing subunit  23.88 
 
 		 686 aa  45.8  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.09 
 
 		 424 aa  45.8  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3013  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.15 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0530  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25 
 
 		 492 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  21.55 
 
 		 387 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1504  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.87 
 
 		 1049 aa  45.8  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000277903  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0660  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  27.44 
 
 		 399 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.127556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0977  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.42 
 
 		 1072 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1011  Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase  27.44 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.649609  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1042  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.06 
 
 		 1060 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0173  carbamoyl-phosphate synthase, medium subunit  25.57 
 
 		 492 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  30.07 
 
 		 891 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>