62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4916 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 283 aa  547  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  54.05 
 
 		 187 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  49.66 
 
 		 198 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  43.6 
 
 		 205 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0841  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 		 201 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3885  hypothetical protein  34.81 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  26.67 
 
 		 548 aa  79  0.00000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  45.63 
 
 		 181 aa  71.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 		 181 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  43 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  43.75 
 
 		 181 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  41.13 
 
 		 185 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  34.46 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  34.46 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 196 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 171 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 		 188 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 179 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  39 
 
 		 187 aa  53.1  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  30.84 
 
 		 188 aa  52.8  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  30.84 
 
 		 186 aa  52.8  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  45.9 
 
 		 181 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  33.64 
 
 		 215 aa  48.9  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 188 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1277  hypothetical protein  25.6 
 
 		 166 aa  47.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.744115  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 197 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 145 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1326  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 157 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.602099 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  30.61 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1312  hydrolase, NUDIX family  49.12 
 
 		 153 aa  43.9  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.869507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 163 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 149 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1682  SH3-like region  45.45 
 
 		 152 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00241886  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2513  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 		 153 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00897802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1943  NUDIX hydrolase  51.72 
 
 		 152 aa  43.5  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.639742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01140  hypothetical protein  49.12 
 
 		 153 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1595  hydrolase, NUDIX family  49.12 
 
 		 153 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000876504 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1991  NUDIX family hydrolase  49.12 
 
 		 153 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2469  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 		 153 aa  43.5  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1297  NUDIX family hydrolase  49.12 
 
 		 153 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1254  NUDIX family hydrolase  49.12 
 
 		 153 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.440982  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01132  bifunctional thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase/ thiamin pyrophosphate hydrolase  49.12 
 
 		 153 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  36.56 
 
 		 160 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  36.56 
 
 		 160 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2582  hypothetical protein  50.91 
 
 		 156 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.287135  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2062  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 150 aa  42.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.894699  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 129 aa  42.7  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 		 137 aa  42.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 142 aa  42.4  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>