81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4248 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  654    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  32.87 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  33.72 
 
 		 561 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  30.49 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  36 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  35.98 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  32.21 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  35.37 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  37.57 
 
 		 453 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  31.44 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  29.47 
 
 		 497 aa  69.3  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  38.26 
 
 		 411 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  42.65 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  34.44 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  31.97 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  29.34 
 
 		 564 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  30.1 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  31.07 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  29.61 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  32.61 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  32.41 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  31.52 
 
 		 431 aa  57  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  29.26 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 		 463 aa  55.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  31.25 
 
 		 391 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  32.23 
 
 		 419 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  30 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  27.88 
 
 		 452 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  28.49 
 
 		 394 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  29.94 
 
 		 479 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  28.05 
 
 		 398 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  28.65 
 
 		 458 aa  52.8  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  21.47 
 
 		 443 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  29.03 
 
 		 432 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  29.94 
 
 		 412 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  27.04 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  33.62 
 
 		 370 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  30.22 
 
 		 448 aa  49.7  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  28.25 
 
 		 391 aa  49.7  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  30.65 
 
 		 444 aa  49.7  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  35.67 
 
 		 325 aa  49.7  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  29.35 
 
 		 418 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  29.8 
 
 		 399 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  31.08 
 
 		 432 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  31.48 
 
 		 410 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  27.5 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  27.95 
 
 		 442 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  26.19 
 
 		 447 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  30.71 
 
 		 431 aa  47  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  23.96 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  20.77 
 
 		 446 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  28.37 
 
 		 392 aa  47  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  31.76 
 
 		 439 aa  47  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  31.4 
 
 		 443 aa  47  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  39.32 
 
 		 393 aa  46.6  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  27.92 
 
 		 440 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  28.48 
 
 		 451 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  29.37 
 
 		 292 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  29.44 
 
 		 423 aa  46.2  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  28.87 
 
 		 443 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  25.99 
 
 		 552 aa  46.2  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  29.24 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  28.32 
 
 		 440 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  30.58 
 
 		 442 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  34.81 
 
 		 405 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  28.87 
 
 		 443 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  30.77 
 
 		 419 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  30.65 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  34.87 
 
 		 453 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  24.62 
 
 		 404 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  42.42 
 
 		 469 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  29.03 
 
 		 443 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  35.58 
 
 		 429 aa  43.5  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0463  hypothetical protein  27.55 
 
 		 428 aa  42.7  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  24.32 
 
 		 444 aa  42.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13184  hypothetical protein  29.37 
 
 		 423 aa  42.7  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  29.03 
 
 		 391 aa  42.7  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  35.25 
 
 		 385 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  24.25 
 
 		 404 aa  42.7  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  47.92 
 
 		 413 aa  42.4  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>