233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0116 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 379 aa  763    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  60.32 
 
 		 357 aa  433  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  54.14 
 
 		 429 aa  393  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  46.8 
 
 		 380 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  53.33 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  51.72 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  51.38 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  51.64 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  50.45 
 
 		 370 aa  360  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2515  phosphotransferase enzyme family protein  53.3 
 
 		 358 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2653  phosphotransferase enzyme family protein  53.03 
 
 		 358 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0946  phosphotransferase enzyme family protein  53.3 
 
 		 876 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1623  phosphotransferase enzyme family protein  53.03 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0243  phosphotransferase enzyme family protein  53.03 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0279  phosphotransferase enzyme family protein  53.03 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.438432  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1426  phosphotransferase enzyme family protein  53.03 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  51.07 
 
 		 355 aa  339  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0521  phosphotransferase enzyme family protein  51.98 
 
 		 358 aa  339  5e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  51.07 
 
 		 355 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  51.07 
 
 		 355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  50.76 
 
 		 355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  50.46 
 
 		 355 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  50.46 
 
 		 355 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  52.17 
 
 		 354 aa  331  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  49.85 
 
 		 355 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  50.61 
 
 		 356 aa  329  6e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  50.77 
 
 		 356 aa  328  7e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  48.32 
 
 		 355 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  47.35 
 
 		 361 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  48.62 
 
 		 348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  45.69 
 
 		 348 aa  286  5e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  45.37 
 
 		 363 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  44.98 
 
 		 353 aa  272  8.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  40.38 
 
 		 351 aa  259  7e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  44.27 
 
 		 344 aa  256  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  44.34 
 
 		 350 aa  252  7e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  40.38 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  43.19 
 
 		 357 aa  243  6e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  43.83 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  40.5 
 
 		 358 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  40.82 
 
 		 339 aa  220  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.85 
 
 		 815 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  40.71 
 
 		 354 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  38.85 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  39.74 
 
 		 356 aa  213  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  39.23 
 
 		 359 aa  209  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  39.75 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  38.14 
 
 		 341 aa  199  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1653  aminoglycoside phosphotransferase  36.56 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.793508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  36.42 
 
 		 353 aa  196  7e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  36.72 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  38.72 
 
 		 344 aa  193  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  37.62 
 
 		 315 aa  192  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  33.93 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  35.44 
 
 		 338 aa  183  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  36.45 
 
 		 338 aa  182  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  35 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  35.96 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  37.79 
 
 		 353 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  36.79 
 
 		 362 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  37.16 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  35.02 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  35.6 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  34.15 
 
 		 344 aa  177  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  36.19 
 
 		 344 aa  176  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  33.65 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  33.99 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2514  aminoglycoside phosphotransferase  37.13 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  35.93 
 
 		 346 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  34.38 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  34.74 
 
 		 354 aa  173  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  35.93 
 
 		 346 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  35.83 
 
 		 451 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  34.65 
 
 		 349 aa  172  9e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3865  aminoglycoside phosphotransferase  36.01 
 
 		 350 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  35.58 
 
 		 343 aa  169  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  36.23 
 
 		 343 aa  169  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  34.8 
 
 		 352 aa  169  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  35.86 
 
 		 359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  35.02 
 
 		 348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  35.97 
 
 		 358 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  37.42 
 
 		 348 aa  166  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  35.06 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  32.87 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  36.88 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  36.09 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  31.84 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  33.22 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  34.35 
 
 		 352 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  35.29 
 
 		 388 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  39.31 
 
 		 352 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  33.89 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  34.37 
 
 		 358 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  34.17 
 
 		 358 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  31.56 
 
 		 362 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  32.89 
 
 		 353 aa  161  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  33.82 
 
 		 360 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  35.97 
 
 		 343 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  34.25 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  36.67 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>