67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4340 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  100 
 
 		 253 aa  504  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  81.42 
 
 		 253 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  49.03 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  45.85 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7019  hypothetical protein  50.98 
 
 		 257 aa  195  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  44.98 
 
 		 249 aa  154  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  34.87 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  35.43 
 
 		 246 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  35.43 
 
 		 246 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  35.43 
 
 		 246 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  34.36 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  30.68 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  31.42 
 
 		 283 aa  95.9  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  33.46 
 
 		 252 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  27.76 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  30.42 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  30.63 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  29.73 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  29.5 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  37.14 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  30.48 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  29.7 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  29.26 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  29.5 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  28.87 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  32.28 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  30.61 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  29.81 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  28.52 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0192  putative ABC transporter membrane protein  32.66 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  29.19 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  32.71 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  29.08 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  28.79 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09550  hypothetical protein  31.5 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.600151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  28.93 
 
 		 308 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  34.15 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  27.86 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  29.37 
 
 		 259 aa  52  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  28.79 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  27.39 
 
 		 248 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  28.43 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  30.35 
 
 		 301 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  29.81 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0750  hypothetical protein  39.13 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  30.3 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  26.29 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  29.41 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0419  hypothetical protein  30.49 
 
 		 284 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0893  hypothetical protein  26.26 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  27.4 
 
 		 293 aa  45.8  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2235  hypothetical protein  28.86 
 
 		 255 aa  45.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  33.66 
 
 		 250 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0312  hypothetical protein  34.23 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.228119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4069  hypothetical protein  26.27 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282629  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  25.25 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  28.66 
 
 		 287 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  28.19 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30560  hypothetical protein  28.03 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  22.66 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  28.3 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  28.99 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  30.66 
 
 		 750 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2000  putative ABC transporter transmembrane protein  37.74 
 
 		 279 aa  42.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1022  hypothetical protein  28.21 
 
 		 265 aa  42.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  36.67 
 
 		 543 aa  42  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.191888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>