96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3576 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  100 
 
 		 451 aa  871    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  57.51 
 
 		 471 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  35.29 
 
 		 361 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  32.27 
 
 		 370 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  29.39 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  30.21 
 
 		 313 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.77 
 
 		 353 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  33.58 
 
 		 336 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  24.45 
 
 		 316 aa  87.4  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  26.18 
 
 		 332 aa  87  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.04 
 
 		 326 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  29.54 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  31.42 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  34.95 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  28.71 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  29.89 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  26.79 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  34.08 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  29.96 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.48 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  26.23 
 
 		 795 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.82 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  27.81 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.98 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.36 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  29.02 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  29.57 
 
 		 461 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  32.4 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  26.04 
 
 		 340 aa  69.7  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  32.96 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  27.78 
 
 		 304 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3488  hypothetical protein  23.44 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.62 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  23.67 
 
 		 1002 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  30.6 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  30.73 
 
 		 306 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  30.56 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  28.67 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  31.08 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  31.77 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  33.51 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  30.26 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  25.1 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  28.28 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  25.45 
 
 		 324 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  29.07 
 
 		 270 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.97 
 
 		 287 aa  54.3  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  25.71 
 
 		 447 aa  53.5  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  24.45 
 
 		 372 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  31.25 
 
 		 232 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0063  phospholipase/carboxylesterase  30.36 
 
 		 227 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  29.71 
 
 		 359 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  28.68 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  25.15 
 
 		 363 aa  50.4  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  27.72 
 
 		 367 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.67 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3360  esterase, PHB depolymerase family  25.39 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.995755 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  25.91 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  24.51 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  26.44 
 
 		 364 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  31.45 
 
 		 369 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  23.26 
 
 		 398 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  31.33 
 
 		 265 aa  47.4  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4102  hypothetical protein  26.59 
 
 		 385 aa  47.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.943667 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  26.77 
 
 		 429 aa  47  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  30.37 
 
 		 378 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3626  esterase, PHB depolymerase  28.14 
 
 		 362 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155827  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1483  PHB depolymerase family esterase  29.41 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0485134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  26.92 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  27.84 
 
 		 659 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1761  esterase, PHB depolymerase family  29.41 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  25.38 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  26.9 
 
 		 276 aa  45.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  24.34 
 
 		 343 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5706  PHB depolymerase family esterase  25.18 
 
 		 438 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137114  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4615  PHB depolymerase family esterase  31.79 
 
 		 359 aa  44.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  28.23 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  29.27 
 
 		 365 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  29.27 
 
 		 365 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  22.48 
 
 		 398 aa  44.3  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4281  PHB depolymerase family esterase  30.61 
 
 		 403 aa  44.3  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  28.57 
 
 		 486 aa  44.3  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  29.27 
 
 		 365 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  30.89 
 
 		 364 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  28.06 
 
 		 355 aa  43.9  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  30.89 
 
 		 367 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  30.89 
 
 		 367 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  30.89 
 
 		 382 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  30.89 
 
 		 382 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  30.89 
 
 		 382 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  30.89 
 
 		 382 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3819  PHB depolymerase family esterase  26.1 
 
 		 419 aa  43.9  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0284  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  30.77 
 
 		 215 aa  43.9  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  29.84 
 
 		 369 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2204  esterase, PHB depolymerase  27.71 
 
 		 367 aa  43.9  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4127  esterase, PHB depolymerase family  26.1 
 
 		 419 aa  43.1  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>