244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3056 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3056  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  262  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22490  conserved hypothetical protein TIGR00149  70.9 
 
 		 155 aa  197  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.282378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1966  hypothetical protein  69.92 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387815  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7042  protein of unknown function UPF0047  67.91 
 
 		 135 aa  186  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1646  protein of unknown function UPF0047  71.11 
 
 		 135 aa  185  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314568  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1861  hypothetical protein  81.4 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0103013 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2358  hypothetical protein  66.42 
 
 		 135 aa  179  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0335235  normal  0.0190831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1363  protein of unknown function UPF0047  62.69 
 
 		 134 aa  168  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2870  hypothetical protein  71.97 
 
 		 133 aa  166  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142366  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3372  hypothetical protein  60.45 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2945  protein of unknown function UPF0047  69.4 
 
 		 135 aa  163  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3612  hypothetical protein  58.96 
 
 		 134 aa  163  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5843  protein of unknown function UPF0047  66.67 
 
 		 135 aa  161  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228828  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1034  hypothetical protein  58.21 
 
 		 133 aa  156  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0183321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2345  hypothetical protein  62.12 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.202939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2392  hypothetical protein  62.12 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2386  hypothetical protein  62.12 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3395  hypothetical protein  55.22 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.465123 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10190  conserved hypothetical protein TIGR00149  63.97 
 
 		 136 aa  150  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12577  hypothetical protein  59.69 
 
 		 129 aa  150  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0908128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2639  hypothetical protein  58.14 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3764  hypothetical protein  55.47 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.434678 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0880  protein of unknown function UPF0047  49.24 
 
 		 136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0539  protein of unknown function UPF0047  51.13 
 
 		 157 aa  133  6.0000000000000005e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1415  hypothetical protein  43.28 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  44.83 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  40.16 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  35.9 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  39.67 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  36.97 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  41.01 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  35.56 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  31.09 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  35.38 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  40.32 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  36.3 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  35.94 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  32.79 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  33.87 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  33.08 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  34.07 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  34.81 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  34.09 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  34.09 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  35.61 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  33.83 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  34.07 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  30.89 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  37.86 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  32.84 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  32.85 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1050  protein of unknown function UPF0047  39.84 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  33.08 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  30.51 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  33.87 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  36 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  30.08 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  29.06 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  33.59 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  30.08 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  33.63 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  29.66 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  30 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  31.71 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  35.34 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  30.89 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  29.06 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  31.15 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1417  hypothetical protein  30.83 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  34.17 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  31.93 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  31.09 
 
 		 133 aa  62  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  38.03 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  30.08 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  38.3 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  39.01 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  30.88 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  27.35 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  32.09 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  31.36 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  32.48 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  31.45 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  26.77 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  28.46 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  32.77 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  34.78 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5282  protein of unknown function UPF0047  35.43 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  33.61 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  31.97 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  33.83 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  27.35 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2724  hypothetical protein  32.09 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.277726  decreased coverage  0.0000377409 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  34.71 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0564298 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  27.41 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  32.84 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1685  protein of unknown function UPF0047  28.46 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  27.13 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  28.24 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  28.21 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>