More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2474 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  100 
 
 		 394 aa  803    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  73.28 
 
 		 394 aa  593  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  68.96 
 
 		 409 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  68.96 
 
 		 395 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  68.96 
 
 		 395 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  68.19 
 
 		 395 aa  531  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  67.68 
 
 		 394 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  65.56 
 
 		 397 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  63.96 
 
 		 394 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  64.89 
 
 		 394 aa  501  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  64.47 
 
 		 394 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  63.61 
 
 		 395 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  62.37 
 
 		 396 aa  500  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  64.81 
 
 		 394 aa  498  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  63.54 
 
 		 395 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  64.38 
 
 		 395 aa  495  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  65.89 
 
 		 395 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  63.2 
 
 		 395 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  62.44 
 
 		 394 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  59.64 
 
 		 395 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  61.22 
 
 		 401 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  58.72 
 
 		 393 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  58.38 
 
 		 394 aa  462  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  59.44 
 
 		 393 aa  455  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  62.31 
 
 		 396 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  59.39 
 
 		 397 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  56.41 
 
 		 389 aa  439  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  55.81 
 
 		 389 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  54.94 
 
 		 401 aa  420  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  53.32 
 
 		 395 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  53.18 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  53.44 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  53.44 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  51.49 
 
 		 406 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  54.8 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04353  sterol carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06380)  47.42 
 
 		 458 aa  349  6e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.238789 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01840  conserved hypothetical protein  47.98 
 
 		 466 aa  339  4e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.680862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  50.63 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4690  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  56.84 
 
 		 234 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  39.9 
 
 		 383 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.29 
 
 		 417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.24 
 
 		 378 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  38.07 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  36.75 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  35.92 
 
 		 390 aa  203  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  38.27 
 
 		 392 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  37 
 
 		 413 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  35.52 
 
 		 407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  36.82 
 
 		 412 aa  196  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  37.04 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  35.15 
 
 		 413 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  35.15 
 
 		 413 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  36.41 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.15 
 
 		 413 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.49 
 
 		 392 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  34.24 
 
 		 413 aa  185  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  36.69 
 
 		 383 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.88 
 
 		 387 aa  182  7e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  34.53 
 
 		 388 aa  182  7e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.12 
 
 		 392 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.82 
 
 		 392 aa  180  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3556  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 383 aa  179  9e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  34.26 
 
 		 394 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  36.01 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  32.46 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  34 
 
 		 387 aa  176  8e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  33.92 
 
 		 387 aa  176  9e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  34.2 
 
 		 388 aa  175  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  37.44 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  34.46 
 
 		 383 aa  173  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  32.91 
 
 		 390 aa  169  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  32.4 
 
 		 387 aa  169  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 		 382 aa  169  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  33.25 
 
 		 388 aa  169  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4131  putative lipid-transfer protein  32.89 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  35.31 
 
 		 402 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  33.67 
 
 		 390 aa  168  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.06 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  32.67 
 
 		 391 aa  167  4e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  33.94 
 
 		 392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  37.06 
 
 		 414 aa  166  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  34.91 
 
 		 398 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  34.17 
 
 		 386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  30.96 
 
 		 404 aa  162  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.91 
 
 		 384 aa  162  7e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  33.26 
 
 		 421 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  31.47 
 
 		 390 aa  162  9e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  34.52 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  35.41 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  35.41 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  35.41 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3568  lipid-transfer protein  34.07 
 
 		 399 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0803413 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  32.33 
 
 		 384 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  36.49 
 
 		 398 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  31.27 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  33.5 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  31.96 
 
 		 388 aa  157  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  34.27 
 
 		 398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672752  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.51 
 
 		 383 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.51 
 
 		 394 aa  156  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>