More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2174 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2174  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 169 aa  330  5e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.150669  normal  0.4191 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1920  heat shock protein Hsp20  66.25 
 
 		 162 aa  218  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143113  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1568  heat shock protein Hsp20  64.33 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  43.59 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  45.51 
 
 		 260 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  43.67 
 
 		 151 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4198  heat shock protein Hsp20  36.48 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1528  heat shock protein Hsp20  33.76 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00309172  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  36.84 
 
 		 152 aa  96.3  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  34.46 
 
 		 151 aa  90.5  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 145 aa  86.3  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 		 147 aa  85.5  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  33.55 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  32.69 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  33.54 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  35.42 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  31.82 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  32.47 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  33.78 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0391  heat shock protein Hsp20  29.61 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000478859  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  34.48 
 
 		 149 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4887  heat shock protein Hsp20  35.53 
 
 		 142 aa  77  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  33.77 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3076  heat shock protein Hsp20  35.33 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  33.56 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  29.93 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  29.93 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  30.87 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  32.8 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  33.11 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  31.01 
 
 		 151 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0540  heat shock protein Hsp20  30.14 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  35.34 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  28.97 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  34.51 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1806  small heat shock protein  31.85 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  29.68 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  28.86 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0423  heat shock protein Hsp20  32 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943695  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  36.36 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  31.34 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  32.59 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  35.85 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  29.29 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  30.87 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  26 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  30.61 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  37.25 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  29.14 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2312  heat shock protein Hsp20  28.57 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  31.94 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  33.65 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  30.26 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  33.65 
 
 		 189 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0289  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0247001  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0391  heat shock protein Hsp20  28.12 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  33.98 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0859  heat shock protein Hsp20  29.33 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1370  small heat shock protein  31.13 
 
 		 144 aa  67  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0982961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  33.65 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  29.05 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0460  heat shock protein Hsp20  29.58 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  30.5 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  32.48 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1660  heat shock protein Hsp20  35.79 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870911  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2704  heat shock protein Hsp20  29.33 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.923873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3573  heat shock protein Hsp20  31.97 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3448  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  38.83 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  33.64 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  28.47 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4812  heat shock protein Hsp20  29.49 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00238667  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4235  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283869  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  35 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  37.76 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  33.76 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  35 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  31.03 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3038  heat shock protein Hsp20  32.64 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.86939 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  31.13 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  28.28 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  28.28 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>