128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1147 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  953    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  56.32 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  41.93 
 
 		 447 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  31.48 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  31.6 
 
 		 472 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  31.58 
 
 		 470 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  34.52 
 
 		 462 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  31.17 
 
 		 482 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  29.44 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  30.48 
 
 		 473 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  29.07 
 
 		 476 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  30.57 
 
 		 482 aa  167  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  35.28 
 
 		 442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  31.37 
 
 		 490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  28.11 
 
 		 459 aa  164  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  29.79 
 
 		 445 aa  163  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  30.16 
 
 		 479 aa  162  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  29.72 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  26.97 
 
 		 467 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  29.36 
 
 		 479 aa  160  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  29.36 
 
 		 479 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  29.36 
 
 		 479 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  30.02 
 
 		 480 aa  157  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  32.2 
 
 		 436 aa  157  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  32.92 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  31.31 
 
 		 473 aa  154  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  28.81 
 
 		 482 aa  152  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  27.31 
 
 		 477 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  27.63 
 
 		 488 aa  146  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  28.92 
 
 		 480 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  31.04 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  32.07 
 
 		 445 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  27.81 
 
 		 798 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  29.01 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  29.37 
 
 		 487 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  27.57 
 
 		 461 aa  144  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  28.13 
 
 		 480 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  31.18 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  29.22 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  27.86 
 
 		 471 aa  138  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  28.33 
 
 		 491 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  32.68 
 
 		 421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  30.19 
 
 		 484 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  27.55 
 
 		 481 aa  133  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  29.69 
 
 		 432 aa  133  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  27.74 
 
 		 462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  26.26 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  26.64 
 
 		 480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  25.89 
 
 		 492 aa  126  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  29.02 
 
 		 437 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  28.82 
 
 		 479 aa  124  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  27.66 
 
 		 488 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  28.29 
 
 		 470 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  27.57 
 
 		 542 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  29.11 
 
 		 427 aa  118  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  28.54 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  28.63 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  27.37 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  28.7 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  28.7 
 
 		 473 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  28.26 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  30.54 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  28.48 
 
 		 473 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  28.48 
 
 		 473 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  28.48 
 
 		 473 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  28.48 
 
 		 473 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  27.17 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  27.47 
 
 		 488 aa  110  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  26.12 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  24.74 
 
 		 488 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  26.42 
 
 		 474 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  22.58 
 
 		 490 aa  106  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  27.09 
 
 		 485 aa  104  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  29.4 
 
 		 475 aa  104  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  27.32 
 
 		 482 aa  103  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  25.22 
 
 		 512 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  27.63 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  23.29 
 
 		 431 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  28.44 
 
 		 478 aa  97.8  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  28.44 
 
 		 478 aa  97.8  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  23.7 
 
 		 431 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  28.44 
 
 		 478 aa  96.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  23.18 
 
 		 435 aa  96.3  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  31.94 
 
 		 200 aa  93.2  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  28.54 
 
 		 478 aa  90.1  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  26.18 
 
 		 479 aa  87.8  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  26 
 
 		 479 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1114  protein of unknown function DUF1254  36.13 
 
 		 196 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  26.4 
 
 		 480 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  26.4 
 
 		 480 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  23.96 
 
 		 452 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  38.41 
 
 		 484 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6665  protein of unknown function DUF1214  23.4 
 
 		 512 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110382  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  39.23 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  25.45 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3377  putative lipoprotein  25 
 
 		 499 aa  73.6  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1116  protein of unknown function DUF1254  30.63 
 
 		 191 aa  69.7  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2605  protein of unknown function DUF1214  38.76 
 
 		 291 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000461285  hitchhiker  0.000899244 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  25.69 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3918  protein of unknown function DUF1214  22.42 
 
 		 512 aa  67.4  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>