More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0168 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  81.3 
 
 		 231 aa  374  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  76.62 
 
 		 231 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  60.17 
 
 		 231 aa  282  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  58.26 
 
 		 231 aa  258  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.67 
 
 		 211 aa  134  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  37.74 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  39.3 
 
 		 211 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  39.8 
 
 		 212 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  36.79 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 		 212 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  37.56 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  38.07 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.39 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  33.96 
 
 		 202 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  25.24 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 		 209 aa  88.2  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  35.85 
 
 		 210 aa  86.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.56 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  26.51 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  28.96 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  30.24 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  31.17 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  32.41 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  24.27 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  23.79 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  23.3 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  23.3 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  23.3 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  23.3 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  28.11 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  25.44 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  26.48 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  25.69 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  26.03 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  31.48 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.94 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  26.06 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  33.73 
 
 		 854 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  31.14 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.65 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  32.54 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  25.97 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  23.94 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  31.39 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  25.13 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.91 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  26.52 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  26.52 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  26.52 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  33.33 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  25.57 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  26.52 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.22 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  28.19 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  27.66 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  31.88 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.59 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.45 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0621  NmrA family protein  29.7 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.837507  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  29.7 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  27.07 
 
 		 267 aa  62  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.75 
 
 		 298 aa  61.6  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1826  NmrA family protein  30.62 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4051  hypothetical protein  27.97 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.018698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0815  putative NADH-flavin reductase-like protein  24.39 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  31.55 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  28.74 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.31 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4907  hypothetical protein  30.73 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 		 346 aa  58.5  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  24.26 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6107  NmrA family protein  28.88 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  26.74 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3754  hypothetical protein  25.23 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  27.41 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1882  putative NADH-flavin reductase-like protein  30.32 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  27.54 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.93 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0186538  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.88 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  28.08 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0199  hypothetical protein  29.65 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.07 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  28.41 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  28.05 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>