192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4887 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4887  nitroreductase  100 
 
 
210 aa  429  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  44.44 
 
 
209 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  39.9 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  44.81 
 
 
211 aa  171  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  40.2 
 
 
214 aa  170  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  43.81 
 
 
212 aa  168  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  41.35 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  42.58 
 
 
215 aa  161  7e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  41.06 
 
 
210 aa  158  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  37.32 
 
 
224 aa  155  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  38.24 
 
 
218 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4284  nitroreductase  42.21 
 
 
232 aa  154  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0793734  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  39.13 
 
 
219 aa  154  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  38.69 
 
 
220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  35.58 
 
 
215 aa  151  5e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4019  nitroreductase  38.73 
 
 
211 aa  149  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  37.68 
 
 
233 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  37.68 
 
 
215 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  36.71 
 
 
210 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  35.2 
 
 
215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1339  nitroreductase  36.06 
 
 
211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011432 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1179  nitroreductase  40.38 
 
 
210 aa  135  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  37.02 
 
 
210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0196  nitroreductase  39.42 
 
 
209 aa  128  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.62 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  34.83 
 
 
218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2677  nitroreductase  36.84 
 
 
216 aa  117  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0833135  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  31.03 
 
 
208 aa  115  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2066  nitroreductase  37.75 
 
 
213 aa  114  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4747  nitroreductase family protein  33.33 
 
 
218 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  33.67 
 
 
218 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  35.98 
 
 
209 aa  111  7.000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  32.24 
 
 
237 aa  111  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  35.03 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  34.74 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  32.86 
 
 
223 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  32.86 
 
 
223 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  31.9 
 
 
235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  36.22 
 
 
206 aa  107  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  30.81 
 
 
226 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  31.63 
 
 
223 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  33.33 
 
 
226 aa  105  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  31.68 
 
 
227 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  33.33 
 
 
218 aa  105  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  31.5 
 
 
227 aa  105  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  31.82 
 
 
227 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.81 
 
 
227 aa  104  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.81 
 
 
227 aa  104  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  28.57 
 
 
209 aa  104  9e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.81 
 
 
227 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  32.32 
 
 
227 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  32.37 
 
 
199 aa  102  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  35.57 
 
 
217 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06175  NAD(P)H-dependent flavin reductase  30.81 
 
 
218 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  29.25 
 
 
217 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  34.17 
 
 
218 aa  99.8  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0176  nitroreductase family protein  31.75 
 
 
222 aa  99.4  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  29.74 
 
 
218 aa  99  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  31.63 
 
 
216 aa  98.6  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  31.98 
 
 
222 aa  98.2  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  35.08 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  31.58 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  33.65 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  29.73 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  30.63 
 
 
217 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  29.95 
 
 
217 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  29.28 
 
 
217 aa  94.7  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  30.63 
 
 
217 aa  94.7  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  31 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1017  nitroreductase  30.26 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  29.28 
 
 
217 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  29.95 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  29.73 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  30.89 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  27.96 
 
 
211 aa  92  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  31.16 
 
 
217 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  28.7 
 
 
218 aa  89.7  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  30.67 
 
 
217 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  30.67 
 
 
217 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  30.41 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  30.41 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  28.86 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  26.8 
 
 
201 aa  82  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3785  dihydropteridine reductase  29.95 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0688  dihydropteridine reductase  33.64 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169469  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  32.47 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  26.29 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2199  nitroreductase family protein  30.81 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  26.29 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  28.79 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  26.92 
 
 
213 aa  79  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  29.29 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  26.35 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  28.92 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2684  dihydropteridine reductase  29.05 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  27.65 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24750  dihydropteridine reductase  30.14 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  28.79 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  28.79 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  28.79 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>