73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4139 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  410  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  40.93 
 
 		 206 aa  157  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  29.74 
 
 		 197 aa  117  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2911  transcriptional regulator, MarR family  29.21 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 206 aa  92  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 212 aa  91.3  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1858  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 270 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 270 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 270 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0069  MarR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  27.44 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0504  transcriptional regulator, TrmB  27.45 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.21026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  24.18 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  25 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  25 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0228  MarR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2690  MarR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4905  putative transcriptional regulator  27.12 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0550  regulatory protein, MarR  29.21 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0117945  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1921  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 139 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  34.31 
 
 		 139 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4209  MarR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 189 aa  51.6  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0466209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 175 aa  48.9  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0900  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 152 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0879  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 152 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.544594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0861  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 152 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0958  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 152 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1128  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 152 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1040  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 152 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69196e-21 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0565  MarR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  20.83 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1045  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.734934  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  30.3 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 154 aa  43.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  27.27 
 
 		 160 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3065  transcriptional regulator, MarR family protein  28.16 
 
 		 140 aa  42.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 152 aa  42.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  32.05 
 
 		 160 aa  42.4  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1001  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 152 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 152 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1854  transcriptional regulator  26.61 
 
 		 138 aa  42  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  25.77 
 
 		 176 aa  41.6  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  26.73 
 
 		 187 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  28.92 
 
 		 137 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0786  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 155 aa  41.2  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0555365  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4823  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 163 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477223  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>