More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0860 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0860  homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 438 aa  880    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.017488  hitchhiker  0.0000000731878 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0284  homoserine dehydrogenase  49.55 
 
 		 441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2251  Homoserine dehydrogenase  35.83 
 
 		 437 aa  242  7.999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  37.19 
 
 		 436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  34.75 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  34.65 
 
 		 441 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  35.17 
 
 		 438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  33.79 
 
 		 436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  34.99 
 
 		 431 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  35.33 
 
 		 436 aa  232  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1199  homoserine dehydrogenase  35.55 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  36.14 
 
 		 437 aa  231  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  36.14 
 
 		 437 aa  231  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  35.93 
 
 		 435 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  36.72 
 
 		 429 aa  230  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  35.41 
 
 		 441 aa  229  7e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  34.87 
 
 		 436 aa  229  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  35.15 
 
 		 442 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  35.95 
 
 		 443 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3996  homoserine dehydrogenase  37.76 
 
 		 439 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  34.53 
 
 		 441 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  35.06 
 
 		 442 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  35.06 
 
 		 442 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  34.53 
 
 		 441 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  35.07 
 
 		 418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1412  homoserine dehydrogenase  34.36 
 
 		 436 aa  226  8e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.874068 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  34.05 
 
 		 428 aa  226  9e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  33.79 
 
 		 434 aa  226  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  35.84 
 
 		 443 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  33.56 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  35.53 
 
 		 440 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  34.66 
 
 		 436 aa  225  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  35.35 
 
 		 443 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2310  Homoserine dehydrogenase  34.29 
 
 		 441 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  35.07 
 
 		 438 aa  223  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  34.76 
 
 		 436 aa  223  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3678  homoserine dehydrogenase  36.28 
 
 		 438 aa  223  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  35.13 
 
 		 430 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  32.71 
 
 		 424 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  36.58 
 
 		 433 aa  223  6e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2074  homoserine dehydrogenase  38.27 
 
 		 435 aa  223  7e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  34.98 
 
 		 435 aa  223  7e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  34.67 
 
 		 436 aa  223  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  33.41 
 
 		 441 aa  222  9e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  33.87 
 
 		 439 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  34.51 
 
 		 436 aa  222  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  35.94 
 
 		 449 aa  222  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  35.84 
 
 		 430 aa  220  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  35.65 
 
 		 427 aa  220  3e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2410  homoserine dehydrogenase  35.04 
 
 		 430 aa  221  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615883  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  34.01 
 
 		 442 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  34.58 
 
 		 441 aa  219  7.999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  33.17 
 
 		 436 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  34.16 
 
 		 444 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  34.68 
 
 		 439 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  34.17 
 
 		 429 aa  219  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  34.63 
 
 		 440 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  34.63 
 
 		 441 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  36.45 
 
 		 432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  33.87 
 
 		 436 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  36.38 
 
 		 437 aa  217  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  33.42 
 
 		 436 aa  217  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  34.2 
 
 		 420 aa  216  4e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  35.81 
 
 		 440 aa  217  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  34.92 
 
 		 431 aa  216  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  34.68 
 
 		 439 aa  216  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  34.47 
 
 		 442 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  35.95 
 
 		 439 aa  216  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1647  homoserine dehydrogenase  35.35 
 
 		 440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  36.03 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2919  homoserine dehydrogenase  33.64 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0217  homoserine dehydrogenase  38.24 
 
 		 422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5546  Homoserine dehydrogenase  35.39 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.195422 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  33.56 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1452  homoserine dehydrogenase  34.24 
 
 		 414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0556341  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  33.1 
 
 		 433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  31.96 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  32.96 
 
 		 427 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  32.92 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  31.96 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1638  Homoserine dehydrogenase  34.99 
 
 		 430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1480  homoserine dehydrogenase  31.89 
 
 		 434 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  32.19 
 
 		 434 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  34.02 
 
 		 441 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  31.44 
 
 		 431 aa  213  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  32.03 
 
 		 463 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  31.44 
 
 		 431 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  35.03 
 
 		 423 aa  213  7e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0185  homoserine dehydrogenase  34.68 
 
 		 415 aa  213  7.999999999999999e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  33.17 
 
 		 434 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  33.49 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  33.72 
 
 		 432 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  33 
 
 		 439 aa  212  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26813  predicted protein  35.43 
 
 		 456 aa  212  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996098  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2231  homoserine dehydrogenase  33.64 
 
 		 448 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0168206  hitchhiker  0.0000403995 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1912  homoserine dehydrogenase  35.9 
 
 		 452 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2809  Homoserine dehydrogenase  31.07 
 
 		 437 aa  211  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2309  homoserine dehydrogenase  36.16 
 
 		 440 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  31.93 
 
 		 438 aa  212  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2190  homoserine dehydrogenase  37.24 
 
 		 447 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0858531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>