248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1138 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 90 aa  185  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  44.44 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 93 aa  80.1  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 91 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  42.31 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  40.24 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4157  XRE family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.555179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3174  XRE family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00826056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3280  XRE family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.843876 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  40.79 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5139  XRE family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  43.59 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  38.82 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2529  transcriptional regulator, XRE family  39.33 
 
 		 93 aa  62  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000784971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1888  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 136 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1724  transcriptional regulator, XRE family  36.05 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  40.24 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  39.53 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0807  helix-turn-helix domain-containing protein  35.56 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  39.19 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0723  transcriptional regulator, XRE family  41.46 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000669172 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0117  putative DNA-binding protein  40.24 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  34.57 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  35.8 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0601  transcriptional regulator, XRE family  35.37 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0593  transcriptional regulator, XRE family  35.44 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0244812  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0834  XRE family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.259279 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1442  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3276  hypothetical protein  41.33 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2419  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1829  transcriptional regulator, XRE family  31.76 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1144  transcriptional regulator, XRE family  53.33 
 
 		 266 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0827  XRE family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.551431  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  51.02 
 
 		 503 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  29.55 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3722  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0676164  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4003  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1124  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.969354  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1879  DNA-binding protein  32.53 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2220  DNA-binding protein  34.57 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0402427  normal  0.0285701 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2425  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1542  hypothetical protein  37.1 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1927  XRE family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0311  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3588  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  32.56 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1817  DNA-binding protein  34.57 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.252724  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  33.93 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  31.4 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3161  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 182 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0455  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 214 aa  47  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000298649 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0381  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 176 aa  46.2  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  29.89 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  40.38 
 
 		 188 aa  46.2  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 209 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0029  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  29.07 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 220 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  40.38 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  29.07 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0925  transcriptional regulator, putative  37.74 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  42.31 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 197 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0791  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 213 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.49267e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3256  helix-turn-helix domain-containing protein  38.71 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4079  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0867  putative transcriptional regulator  37.74 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0318952  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1443  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0538  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  44.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1459  helix-turn-helix domain protein  41.67 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0099  DNA-binding protein  28.74 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  32.76 
 
 		 186 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>