More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0281 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03283  glycogen debranching enzyme  99.54 
 
 		 657 aa  1354    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000400543  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0283  glycogen debranching enzyme GlgX  99.7 
 
 		 657 aa  1358    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000106954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3910  glycogen debranching enzyme  99.54 
 
 		 657 aa  1356    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0148  glycogen debranching enzyme  60.33 
 
 		 662 aa  804    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3907  glycogen debranching enzyme  85.08 
 
 		 658 aa  1179    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.385353  normal  0.48763 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0224  glycogen debranching enzyme  60.58 
 
 		 656 aa  816    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0281  glycogen debranching enzyme  100 
 
 		 657 aa  1360    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00281975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0278  glycogen debranching enzyme  59.67 
 
 		 655 aa  814    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4119  glycogen debranching enzyme  60.49 
 
 		 662 aa  808    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.548863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3631  glycogen debranching enzyme  100 
 
 		 657 aa  1360    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4135  glycogen debranching enzyme  63.21 
 
 		 658 aa  858    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4743  glycogen debranching enzyme  99.54 
 
 		 657 aa  1355    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03236  hypothetical protein  99.54 
 
 		 657 aa  1354    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00116729  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3846  glycogen debranching enzyme  85.24 
 
 		 658 aa  1181    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.825937 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3738  glycogen debranching enzyme  85.08 
 
 		 658 aa  1180    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3936  glycogen debranching enzyme  63.36 
 
 		 658 aa  867    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4005  glycogen debranching enzyme  60.49 
 
 		 662 aa  805    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3713  glycogen debranching enzyme  99.54 
 
 		 657 aa  1355    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.723997  normal  0.535779 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3804  glycogen debranching enzyme  85.08 
 
 		 658 aa  1179    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3893  glycogen debranching enzyme  99.54 
 
 		 657 aa  1357    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4646  glycogen debranching enzyme  62.67 
 
 		 661 aa  862    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.298898 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3839  glycogen debranching enzyme  79 
 
 		 657 aa  1088    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.90909 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3727  glycogen debranching enzyme  85.08 
 
 		 658 aa  1180    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  49.16 
 
 		 710 aa  620  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0888  glycogen operon protein  51.32 
 
 		 660 aa  615  1e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  47.88 
 
 		 721 aa  597  1e-169  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  48.31 
 
 		 701 aa  593  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1103  glycogen debranching enzyme GlgX  48.92 
 
 		 695 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.512458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  46.73 
 
 		 758 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  47.8 
 
 		 730 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  48.4 
 
 		 755 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  49.11 
 
 		 757 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  47.51 
 
 		 706 aa  584  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  48.16 
 
 		 755 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  48.71 
 
 		 703 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  46.98 
 
 		 707 aa  579  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  46.11 
 
 		 718 aa  578  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  46.58 
 
 		 758 aa  580  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  47.27 
 
 		 706 aa  578  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  47.87 
 
 		 701 aa  580  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  48.63 
 
 		 719 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  46.96 
 
 		 701 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  46.11 
 
 		 720 aa  579  1e-164  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  46.96 
 
 		 714 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  45.99 
 
 		 704 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1463  glycogen debranching protein GlgX  46.94 
 
 		 692 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  46.96 
 
 		 714 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  46.46 
 
 		 1537 aa  575  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  47.49 
 
 		 720 aa  578  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  46.35 
 
 		 712 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0543  glycogen debranching enzyme GlgX  48.86 
 
 		 704 aa  575  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0247855  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  46.96 
 
 		 714 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  48.08 
 
 		 716 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  45.99 
 
 		 715 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  47.23 
 
 		 733 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  47.02 
 
 		 709 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  46.58 
 
 		 720 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  45.01 
 
 		 720 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  45.71 
 
 		 714 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  47.28 
 
 		 727 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  51.03 
 
 		 729 aa  568  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  48.31 
 
 		 779 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  46.46 
 
 		 710 aa  570  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  48.08 
 
 		 716 aa  572  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  46.2 
 
 		 717 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  46.05 
 
 		 756 aa  568  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  46.78 
 
 		 708 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  46.35 
 
 		 717 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  47.53 
 
 		 751 aa  567  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  46.5 
 
 		 711 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  47.6 
 
 		 704 aa  566  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  46.35 
 
 		 711 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  46.2 
 
 		 717 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  46.96 
 
 		 727 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  44.59 
 
 		 708 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  46.42 
 
 		 713 aa  562  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  46.18 
 
 		 717 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3485  glycogen debranching protein GlgX  46.91 
 
 		 692 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  45.21 
 
 		 723 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  48.54 
 
 		 733 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  46.81 
 
 		 745 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  44.46 
 
 		 720 aa  560  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0238  glycogen operon protein GlgX  48.38 
 
 		 754 aa  560  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137822  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  45.51 
 
 		 719 aa  560  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  46.65 
 
 		 714 aa  561  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1463  glycogen debranching enzyme GlgX  46.82 
 
 		 708 aa  559  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.66197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  47.58 
 
 		 733 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  48 
 
 		 719 aa  561  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  44.46 
 
 		 738 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2864  putative glycogen operon protein GlgX  45.36 
 
 		 739 aa  561  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0902  glycogen debranching enzyme GlgX  47.67 
 
 		 694 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  45.19 
 
 		 707 aa  559  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6824  glycogen debranching enzyme GlgX  45.77 
 
 		 739 aa  561  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  45.19 
 
 		 700 aa  561  1e-158  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  44.41 
 
 		 720 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2226  glycosidase  47.67 
 
 		 694 aa  558  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  46.28 
 
 		 701 aa  558  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2937  glycogen debranching enzyme GlgX  46.75 
 
 		 703 aa  557  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  44.41 
 
 		 722 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  44.38 
 
 		 738 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>