73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2273 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  99.48 
 
 		 191 aa  390  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 		 191 aa  391  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  96.86 
 
 		 191 aa  380  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  96.86 
 
 		 191 aa  380  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  95.29 
 
 		 194 aa  374  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  94.76 
 
 		 194 aa  374  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  95.81 
 
 		 194 aa  374  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  94.24 
 
 		 193 aa  370  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  93.72 
 
 		 194 aa  371  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  83.16 
 
 		 190 aa  331  5e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  94.37 
 
 		 247 aa  274  7e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  64.92 
 
 		 189 aa  265  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  63.87 
 
 		 189 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  62.69 
 
 		 193 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  62.69 
 
 		 193 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  65.36 
 
 		 192 aa  252  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  61.58 
 
 		 202 aa  247  8e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  83.94 
 
 		 138 aa  243  9e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  63.21 
 
 		 193 aa  238  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  56.69 
 
 		 293 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  36.11 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  37.91 
 
 		 206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  38.67 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  36.11 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  35.56 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  35.56 
 
 		 209 aa  115  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  34.97 
 
 		 200 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  59.41 
 
 		 442 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 		 200 aa  101  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00847  e14 prophage; predicted tail fiber assembly protein  33.51 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00853  hypothetical protein  33.51 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  33.16 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3034  Tail fiber assembly protein homolog  32.79 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774391 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0300  Tail fiber assembly protein homolog  33.16 
 
 		 197 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  80 
 
 		 89 aa  92  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  78.33 
 
 		 89 aa  90.1  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  76.67 
 
 		 88 aa  89  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  35.16 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1181  phage tail assembly protein  42.86 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128725  normal  0.507373 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2197  hypothetical protein  28.85 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.107741  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1649  hypothetical protein  75 
 
 		 82 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  45.45 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01356  hypothetical protein  97.22 
 
 		 36 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  50 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2077  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  66.67 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  35.71 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  52.31 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1636  tail fiber assembly protein, truncation  100 
 
 		 30 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00269715  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  31.14 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  41.67 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  40.62 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  50 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1052  phage tail assembly chaperone gp38  39.24 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  44.62 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  46.97 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3934  tail fiber assembly domain protein  44.07 
 
 		 92 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  46.15 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1920  putative tail fiber assembly-like protein  30.95 
 
 		 250 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1450  tail fiber assembly protein, putative  37.5 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.422094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2241  phage tail assembly protein  62.16 
 
 		 47 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.206119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 		 138 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2371  putative phage tail fiber assembly protein  33.33 
 
 		 139 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.786543  normal  0.362441 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  46.03 
 
 		 175 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0684  tail fiber assembly protein  38.75 
 
 		 236 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5072  tail fiber assembly protein  38.75 
 
 		 236 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1305  tail assembly chaperone gp38  31.96 
 
 		 114 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.059045  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2808  tail assembly chaperone gp38  45.76 
 
 		 139 aa  45.1  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3110  tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 		 145 aa  44.7  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130843  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0627  hypothetical protein  37.5 
 
 		 116 aa  44.7  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0929  tail assembly chaperone gp38  31.9 
 
 		 172 aa  44.7  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0182  hypothetical protein  34.72 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1861  bacteriophage-acquired protein  28.26 
 
 		 253 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>