More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02711 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02711  predicted oxidoreductase, Fe-S subunit  100 
 
 		 1032 aa  2158    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0814  selenate reductase YgfK  99.81 
 
 		 1032 aa  2154    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3011  putative selenate reductase subunit YgfK  98.93 
 
 		 1032 aa  2140    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1671  selenate reductase YgfK  42.72 
 
 		 1009 aa  807    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4168  putative selenate reductase subunit YgfK  99.22 
 
 		 1032 aa  2141    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02673  hypothetical protein  100 
 
 		 1032 aa  2158    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1949  putative selenate reductase subunit YgfK  45.54 
 
 		 1016 aa  845    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00511971 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3038  putative selenate reductase subunit YgfK  100 
 
 		 1032 aa  2158    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0237  putative selenate reductase subunit YgfK  44.41 
 
 		 997 aa  810    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0423  selenate reductase YgfK  38.4 
 
 		 1075 aa  654    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0830  putative selenate reductase subunit YgfK  99.61 
 
 		 1032 aa  2149    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2656  selenate reductase YgfK  41.8 
 
 		 991 aa  755    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3204  putative selenate reductase subunit YgfK  99.13 
 
 		 1032 aa  2140    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1428  selenate reductase YgfK  41.47 
 
 		 854 aa  478  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1495  hypothetical protein  43.62 
 
 		 560 aa  356  1e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2603  hypothetical protein  39.36 
 
 		 698 aa  288  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.661586  normal  0.233906 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  39.27 
 
 		 1150 aa  272  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.94 
 
 		 1126 aa  257  9e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  35.97 
 
 		 493 aa  242  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.28 
 
 		 1410 aa  239  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.36 
 
 		 1421 aa  234  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  35.66 
 
 		 653 aa  233  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.2 
 
 		 1425 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  30.96 
 
 		 658 aa  232  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.5 
 
 		 996 aa  231  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.04 
 
 		 1425 aa  231  6e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  35.9 
 
 		 471 aa  231  7e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.73 
 
 		 1425 aa  230  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.97 
 
 		 1406 aa  229  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.29 
 
 		 1426 aa  228  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  35.51 
 
 		 464 aa  229  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  32.32 
 
 		 1387 aa  228  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  30.19 
 
 		 1385 aa  227  7e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.94 
 
 		 1424 aa  227  7e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  32.17 
 
 		 653 aa  226  1e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  32.05 
 
 		 1412 aa  226  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.62 
 
 		 476 aa  226  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  37.8 
 
 		 653 aa  225  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.59 
 
 		 465 aa  225  3e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  34.93 
 
 		 469 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  34.35 
 
 		 465 aa  224  6e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  33.48 
 
 		 465 aa  224  6e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  31.46 
 
 		 699 aa  224  7e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.4 
 
 		 1440 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2274  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.43 
 
 		 542 aa  222  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0531449  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.42 
 
 		 1428 aa  222  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.84 
 
 		 1432 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.63 
 
 		 1432 aa  220  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  30.12 
 
 		 688 aa  220  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.25 
 
 		 466 aa  220  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.17 
 
 		 1440 aa  219  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.49 
 
 		 464 aa  219  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  35.6 
 
 		 470 aa  218  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.21 
 
 		 1432 aa  218  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.56 
 
 		 457 aa  218  5.9999999999999996e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  35.01 
 
 		 455 aa  217  8e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0510  Fe(III) reductase, beta subunit  36.24 
 
 		 672 aa  217  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.02 
 
 		 463 aa  217  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  36.07 
 
 		 654 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.83 
 
 		 479 aa  215  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  33.41 
 
 		 468 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  34.03 
 
 		 468 aa  215  3.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  33.55 
 
 		 470 aa  215  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  35.81 
 
 		 463 aa  215  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  35.45 
 
 		 469 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0770  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.54 
 
 		 546 aa  214  9e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3023  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.11 
 
 		 672 aa  213  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0413  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  29.21 
 
 		 659 aa  212  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.933547  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  33.33 
 
 		 1005 aa  211  6e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1594  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.94 
 
 		 609 aa  210  9e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.47 
 
 		 1480 aa  209  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.933284 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  33.99 
 
 		 469 aa  208  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.22 
 
 		 1487 aa  208  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3208  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  33.8 
 
 		 947 aa  207  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.950859  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  35.43 
 
 		 468 aa  207  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  34.27 
 
 		 469 aa  207  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  33.13 
 
 		 1073 aa  207  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.25 
 
 		 469 aa  207  8e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0659  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.62 
 
 		 670 aa  204  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.18 
 
 		 466 aa  204  7e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00210  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  31.01 
 
 		 612 aa  204  8e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.301732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.94 
 
 		 480 aa  204  9e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.32 
 
 		 761 aa  203  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.69 
 
 		 474 aa  203  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2503  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.8 
 
 		 663 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0958  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  33.63 
 
 		 944 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.33 
 
 		 476 aa  203  1.9999999999999998e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  33.95 
 
 		 469 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2986  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.29 
 
 		 552 aa  203  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144587 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2314  respiratory-chain NADH dehydrogenase, 51 kDa subunit  37.03 
 
 		 707 aa  201  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0653639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0672  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.39 
 
 		 670 aa  201  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0858799999999997e-27 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0850  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  32.96 
 
 		 942 aa  201  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0703  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  33.85 
 
 		 944 aa  201  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2184  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  29.81 
 
 		 541 aa  200  9e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.544077  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  33.11 
 
 		 503 aa  200  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2800  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.18 
 
 		 608 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  30.74 
 
 		 612 aa  199  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.96 
 
 		 467 aa  199  2.0000000000000003e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  34.05 
 
 		 462 aa  199  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.01 
 
 		 448 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.756124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>