85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1165 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  100 
 
 		 984 aa  1971    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  47.84 
 
 		 997 aa  907    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  56 
 
 		 1100 aa  1109    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  42.19 
 
 		 1000 aa  695    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  22.1 
 
 		 919 aa  176  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  22.74 
 
 		 909 aa  164  7e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  24.35 
 
 		 968 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  22.22 
 
 		 911 aa  152  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  22.18 
 
 		 951 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  24.61 
 
 		 960 aa  125  6e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  21.78 
 
 		 969 aa  122  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  21.78 
 
 		 969 aa  122  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  29.18 
 
 		 1039 aa  116  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  25.31 
 
 		 780 aa  94.4  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  25.15 
 
 		 781 aa  92  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  24.69 
 
 		 788 aa  87.8  8e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  24.69 
 
 		 788 aa  86.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  20.37 
 
 		 803 aa  85.1  0.000000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  26.32 
 
 		 781 aa  84.7  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  23.99 
 
 		 788 aa  82.8  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  21.91 
 
 		 794 aa  78.6  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  20.31 
 
 		 786 aa  77.8  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  27.13 
 
 		 783 aa  75.1  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  28.44 
 
 		 947 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  27.33 
 
 		 951 aa  69.7  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  29.27 
 
 		 1049 aa  67  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  26.79 
 
 		 962 aa  66.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.63 
 
 		 958 aa  65.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1042 aa  64.3  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  28.18 
 
 		 1053 aa  63.5  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.65 
 
 		 1048 aa  63.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  27.7 
 
 		 1015 aa  62.4  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  26.92 
 
 		 991 aa  62  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  22.65 
 
 		 991 aa  61.6  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.28 
 
 		 916 aa  61.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  29.81 
 
 		 989 aa  60.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1049 aa  60.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  24.04 
 
 		 976 aa  60.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1049 aa  60.1  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1048 aa  59.3  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  23.24 
 
 		 994 aa  58.2  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.3 
 
 		 957 aa  58.2  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  24.55 
 
 		 896 aa  57  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  25.4 
 
 		 993 aa  55.1  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  29.1 
 
 		 1037 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  33.17 
 
 		 1049 aa  54.3  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.66 
 
 		 1042 aa  53.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  24.62 
 
 		 1052 aa  51.6  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1356  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  30.77 
 
 		 935 aa  51.2  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188722  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  22.02 
 
 		 858 aa  50.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  24.16 
 
 		 1047 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1243  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  30.73 
 
 		 968 aa  50.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0167838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1570  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  31.75 
 
 		 1043 aa  50.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  27.16 
 
 		 990 aa  50.4  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  27.41 
 
 		 988 aa  49.7  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.94 
 
 		 1048 aa  49.7  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  25.46 
 
 		 1000 aa  49.7  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.26 
 
 		 957 aa  49.3  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  24.77 
 
 		 1047 aa  49.3  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  40.85 
 
 		 1016 aa  48.9  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.9 
 
 		 836 aa  48.5  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  31.29 
 
 		 276 aa  48.5  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  27.41 
 
 		 913 aa  48.1  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  28.14 
 
 		 912 aa  47.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  29.65 
 
 		 287 aa  47.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2361  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.52 
 
 		 1113 aa  47.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  30.95 
 
 		 295 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04130  hypothetical protein  21.55 
 
 		 864 aa  46.6  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1321  methyltransferase type 11  25.08 
 
 		 915 aa  47  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1052 aa  46.6  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  28.92 
 
 		 991 aa  46.6  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  25.73 
 
 		 1041 aa  46.2  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  24.25 
 
 		 1052 aa  46.2  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  31.14 
 
 		 311 aa  46.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  24.09 
 
 		 1043 aa  46.2  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  29.75 
 
 		 312 aa  45.8  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  24.47 
 
 		 1054 aa  45.8  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  25.62 
 
 		 856 aa  45.8  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2040  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.31 
 
 		 1146 aa  45.8  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  28.4 
 
 		 293 aa  45.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08480  RecB family exonuclease  27.78 
 
 		 889 aa  45.1  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.198348 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0987  hypothetical protein  23.72 
 
 		 911 aa  45.1  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000754464  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  23.43 
 
 		 1016 aa  44.7  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  24.01 
 
 		 1045 aa  44.7  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  23.37 
 
 		 999 aa  45.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>