61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3041 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 175 aa  358  3e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  68.92 
 
 		 151 aa  222  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  63.27 
 
 		 168 aa  205  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  63.09 
 
 		 149 aa  194  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  54.61 
 
 		 152 aa  158  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  50 
 
 		 156 aa  140  9e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  34.4 
 
 		 156 aa  89  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  36.27 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  31.43 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  27.78 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  30.19 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  36.47 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  34.65 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  38.37 
 
 		 222 aa  54.3  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0358  protein of unknown function UPF0153  32.43 
 
 		 258 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  32.11 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  29.46 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0146  hypothetical protein  30.77 
 
 		 121 aa  51.6  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0057515  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  33.62 
 
 		 180 aa  51.2  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0883  hypothetical protein  29.82 
 
 		 133 aa  50.8  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0924  conserved hypothetical protein (UPF0153 domain protein)  30.77 
 
 		 122 aa  50.4  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1904  hypothetical protein  27.42 
 
 		 222 aa  50.4  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0785704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1308  protein of unknown function UPF0153  30.56 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0836472  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1540  hypothetical protein  27.27 
 
 		 148 aa  50.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  34.88 
 
 		 112 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  29.09 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0729  hypothetical protein  27.78 
 
 		 127 aa  50.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121863  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  31.82 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  27.86 
 
 		 179 aa  47.8  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  30.77 
 
 		 142 aa  47.8  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1950  hypothetical protein  31.33 
 
 		 122 aa  47.4  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00178509  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  23.96 
 
 		 124 aa  46.6  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  31.03 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0491  hypothetical protein  30.77 
 
 		 246 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1054  hypothetical protein  25.74 
 
 		 263 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.212731 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0599  hypothetical protein  30.53 
 
 		 113 aa  45.8  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000657339  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1893  protein of unknown function UPF0153  30.95 
 
 		 117 aa  45.8  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  29.76 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  29.76 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0626  hypothetical protein  30.43 
 
 		 110 aa  45.1  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000851469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  31.11 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  31.73 
 
 		 153 aa  45.1  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  32.18 
 
 		 124 aa  45.1  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  27.84 
 
 		 224 aa  45.1  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1740  hypothetical protein  32.35 
 
 		 137 aa  44.7  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0376744 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_567  hypothetical protein  31.63 
 
 		 113 aa  44.7  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  23.85 
 
 		 271 aa  44.3  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1831  protein of unknown function UPF0153  30.12 
 
 		 257 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0953525 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  28.57 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  32.26 
 
 		 124 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1468  hypothetical protein  28 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  32.26 
 
 		 124 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2098  protein of unknown function UPF0153  31.11 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0032  protein of unknown function UPF0153  30.12 
 
 		 257 aa  43.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107691  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0356  hypothetical protein  29.91 
 
 		 237 aa  42  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0387  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  41.2  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  28.92 
 
 		 167 aa  41.2  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1215  hypothetical protein  30.12 
 
 		 260 aa  41.2  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145347  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  28.05 
 
 		 164 aa  41.2  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3606  hypothetical protein  26.55 
 
 		 261 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1741  protein of unknown function UPF0153  28.45 
 
 		 250 aa  40.8  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00416272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>