267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2606 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2606  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 148 aa  295  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1262  large conductance mechanosensitive channel protein  53.74 
 
 		 148 aa  177  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0025  large-conductance mechanosensitive channel  56.21 
 
 		 155 aa  176  9e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00280832  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  53.06 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  56.08 
 
 		 161 aa  174  5e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1202  large-conductance mechanosensitive channel  52.03 
 
 		 150 aa  170  5.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00425466  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  50.98 
 
 		 157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  61.21 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  45.03 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  49.02 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  52.41 
 
 		 143 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  46.36 
 
 		 155 aa  158  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0532  large conductance mechanosensitive channel protein  47.33 
 
 		 154 aa  157  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  56.67 
 
 		 151 aa  157  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  48.98 
 
 		 150 aa  152  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  46.26 
 
 		 145 aa  149  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  70.16 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1689  large conductance mechanosensitive channel protein  51.35 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  47.26 
 
 		 151 aa  146  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  47.26 
 
 		 151 aa  146  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  52.7 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  47.02 
 
 		 150 aa  144  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0387  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0381  large conductance mechanosensitive channel protein  48.65 
 
 		 144 aa  137  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0379  large conductance mechanosensitive channel protein  46.9 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0181396  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0747  large conductance mechanosensitive channel protein  51.37 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  48.82 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  49.59 
 
 		 133 aa  124  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  53.45 
 
 		 142 aa  123  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  41.22 
 
 		 136 aa  123  9e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  43.05 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  48.82 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  48.82 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 163 aa  120  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0109  large conductance mechanosensitive channel protein  46.58 
 
 		 153 aa  120  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  51.24 
 
 		 144 aa  120  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  47.2 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  51.97 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  50.39 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  51.18 
 
 		 146 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  50.82 
 
 		 151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1343  large conductance mechanosensitive channel protein  55.05 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.954232  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  48.33 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  48.33 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  48.33 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  48.33 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  52.46 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  48.33 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  48.33 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  48.33 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  48.33 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  48.33 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  47.54 
 
 		 137 aa  115  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  48.33 
 
 		 137 aa  115  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  51.61 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  48.36 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  48.36 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  48.84 
 
 		 145 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  47.54 
 
 		 136 aa  114  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  50.82 
 
 		 136 aa  114  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 141 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 141 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  48.36 
 
 		 136 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2963  large conductance mechanosensitive channel protein  51.33 
 
 		 142 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  51.64 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  44.37 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  46.46 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  46.46 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  46.46 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3512  large conductance mechanosensitive channel protein  48.72 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.178106  normal  0.287508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  50.88 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  46.46 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  51.64 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  50.88 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  47.97 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  47.2 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  50.82 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  50.82 
 
 		 137 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  45.9 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  50.82 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3094  large-conductance mechanosensitive channel  51.79 
 
 		 144 aa  110  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.350384  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  51.64 
 
 		 154 aa  110  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3035  large conductance mechanosensitive channel protein  47.37 
 
 		 135 aa  110  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  50.82 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1187  large conductance mechanosensitive channel protein  52.63 
 
 		 143 aa  110  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  46.72 
 
 		 141 aa  110  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3208  large conductance mechanosensitive channel protein  52.17 
 
 		 141 aa  110  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0654251  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  46.49 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  46.43 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  47.2 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1242  large conductance mechanosensitive channel protein  48.25 
 
 		 134 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335343  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3333  large-conductance mechanosensitive channel  49.56 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662595  hitchhiker  0.000286923 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  43.07 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  51.35 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  48.36 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  37.33 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  43.8 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  51.72 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0788  large-conductance mechanosensitive channel  51.33 
 
 		 142 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.112062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>