More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2415 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  43.72 
 
 		 877 aa  742    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  38.67 
 
 		 903 aa  646    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  41.73 
 
 		 891 aa  710    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  44.13 
 
 		 876 aa  723    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  47.18 
 
 		 870 aa  781    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  45.77 
 
 		 894 aa  774    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  55.88 
 
 		 883 aa  1003    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  43.72 
 
 		 877 aa  743    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  42.56 
 
 		 880 aa  652    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  43.95 
 
 		 877 aa  746    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  43.95 
 
 		 891 aa  743    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  43.83 
 
 		 891 aa  742    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  41.06 
 
 		 892 aa  673    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  43.83 
 
 		 891 aa  742    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  40.29 
 
 		 879 aa  656    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  45.21 
 
 		 850 aa  720    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  39.17 
 
 		 930 aa  636    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  43.9 
 
 		 876 aa  723    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  39.34 
 
 		 936 aa  650    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  46.69 
 
 		 878 aa  777    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  39.51 
 
 		 903 aa  641    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  41.14 
 
 		 898 aa  650    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  46.02 
 
 		 872 aa  762    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  42.97 
 
 		 891 aa  734    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  38.27 
 
 		 903 aa  640    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  44.33 
 
 		 873 aa  731    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  41.56 
 
 		 892 aa  682    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  41.03 
 
 		 892 aa  682    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  43.72 
 
 		 877 aa  742    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  39.5 
 
 		 932 aa  648    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  45.12 
 
 		 876 aa  736    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  43.9 
 
 		 876 aa  723    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  43.95 
 
 		 877 aa  742    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  49.55 
 
 		 885 aa  838    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  42.98 
 
 		 893 aa  673    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  40.92 
 
 		 892 aa  683    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  43.72 
 
 		 877 aa  743    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  46.52 
 
 		 895 aa  772    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  43.03 
 
 		 893 aa  674    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1892  DNA polymerase I  41.26 
 
 		 930 aa  640    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  41.34 
 
 		 892 aa  648    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  46.56 
 
 		 896 aa  750    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  42.95 
 
 		 888 aa  679    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  43.61 
 
 		 877 aa  744    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  38.67 
 
 		 903 aa  645    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  40.02 
 
 		 885 aa  644    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  44.67 
 
 		 877 aa  762    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  100 
 
 		 888 aa  1824    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  45.4 
 
 		 866 aa  739    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  45.4 
 
 		 866 aa  738    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  52.34 
 
 		 878 aa  880    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  46.54 
 
 		 866 aa  768    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  49.2 
 
 		 868 aa  818    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  43.63 
 
 		 877 aa  686    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  43.44 
 
 		 896 aa  696    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  43.28 
 
 		 879 aa  650    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  42.26 
 
 		 888 aa  675    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  43.3 
 
 		 855 aa  653    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  40.31 
 
 		 902 aa  639    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  39.87 
 
 		 893 aa  640    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  38.74 
 
 		 946 aa  643    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  39.8 
 
 		 875 aa  634  1e-180  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  39.72 
 
 		 928 aa  633  1e-180  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  40.13 
 
 		 924 aa  635  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  39.76 
 
 		 936 aa  630  1e-179  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  40.39 
 
 		 903 aa  630  1e-179  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  39.33 
 
 		 926 aa  625  1e-178  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  38.95 
 
 		 979 aa  625  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  38.89 
 
 		 930 aa  625  1e-178  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  39.23 
 
 		 928 aa  627  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2846  DNA polymerase I  37.88 
 
 		 943 aa  624  1e-177  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411951  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  40.2 
 
 		 896 aa  620  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  40.38 
 
 		 896 aa  621  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  40.3 
 
 		 929 aa  619  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  39.52 
 
 		 926 aa  619  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  38.51 
 
 		 906 aa  616  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  39 
 
 		 932 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  39 
 
 		 932 aa  617  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  39 
 
 		 932 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  38.91 
 
 		 951 aa  617  1e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  38.73 
 
 		 912 aa  618  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  38.94 
 
 		 928 aa  616  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  39.6 
 
 		 893 aa  616  1e-175  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  39.76 
 
 		 916 aa  618  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  39.5 
 
 		 928 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  39.5 
 
 		 928 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  39.5 
 
 		 928 aa  613  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  39.5 
 
 		 928 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  39.5 
 
 		 928 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  38.06 
 
 		 924 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  39.5 
 
 		 928 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  39.5 
 
 		 928 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  38.82 
 
 		 911 aa  613  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  39.85 
 
 		 929 aa  614  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  39.48 
 
 		 934 aa  613  9.999999999999999e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  37.79 
 
 		 893 aa  611  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  39.4 
 
 		 928 aa  609  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  39.4 
 
 		 928 aa  610  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  38.35 
 
 		 903 aa  608  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  37.73 
 
 		 939 aa  605  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>