More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4218 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009959  Dshi_4218  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  637    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  32.31 
 
 		 326 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  33.23 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  34.43 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  30.67 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  31.15 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  31.83 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  32.89 
 
 		 329 aa  148  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  32.89 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  32.12 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  32.82 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  33.65 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  32.11 
 
 		 337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  32.96 
 
 		 322 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  32.77 
 
 		 317 aa  146  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  31.17 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2701  hypothetical protein  33.22 
 
 		 420 aa  146  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  31.67 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  32.77 
 
 		 317 aa  145  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  31.31 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  33.44 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  32.56 
 
 		 323 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  32.29 
 
 		 356 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1221  hypothetical protein  34.1 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  34.41 
 
 		 326 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  36.05 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  32.89 
 
 		 337 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  32.33 
 
 		 326 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  31.96 
 
 		 325 aa  142  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  31.36 
 
 		 335 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  31.67 
 
 		 326 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  30.16 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  34.11 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  32.07 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  31.97 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  32.45 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  32.63 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  33.11 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  31.97 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  34.69 
 
 		 353 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  34.69 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  33.55 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  29.97 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  31.05 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  33.33 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  30.25 
 
 		 325 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  32.18 
 
 		 326 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  31.6 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  29.43 
 
 		 320 aa  139  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  29.73 
 
 		 327 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  30.77 
 
 		 338 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  31.63 
 
 		 324 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  31.03 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  31.11 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  31.8 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  31.7 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  34.16 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  35.56 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  32.47 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  31.25 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2441  hypothetical protein  35.47 
 
 		 320 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  32.61 
 
 		 331 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  33.44 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3011  twin-arginine translocation pathway signal  32.78 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2765  hypothetical protein  30.65 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  30.59 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  29.58 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  30.56 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  33.71 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  31.91 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  30.84 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  31.61 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  31.44 
 
 		 335 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  32.23 
 
 		 330 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  32.18 
 
 		 327 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5610  hypothetical protein  33.33 
 
 		 333 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  34.11 
 
 		 326 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  31.66 
 
 		 325 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  30.1 
 
 		 328 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5251  hypothetical protein  29.84 
 
 		 338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  35.18 
 
 		 329 aa  135  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  32.33 
 
 		 325 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0476  hypothetical protein  30.89 
 
 		 330 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  32.57 
 
 		 327 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  30.26 
 
 		 328 aa  135  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  32.33 
 
 		 327 aa  135  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0467  hypothetical protein  30.89 
 
 		 345 aa  135  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  29.23 
 
 		 334 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2537  hypothetical protein  30.18 
 
 		 329 aa  135  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  30.77 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4085  hypothetical protein  33.66 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0012  hypothetical protein  29.37 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  34.09 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  32.9 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  30.56 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  31.02 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  34.8 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  30.96 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0709  hypothetical protein  31.53 
 
 		 325 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  31.56 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>