More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1066 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0615  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.72 
 
 		 669 aa  729    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0642  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.72 
 
 		 669 aa  729    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3750  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.55 
 
 		 669 aa  729    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3935  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.43 
 
 		 668 aa  726    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1531  fumarate reductase flavoprotein subunit  67.53 
 
 		 618 aa  865    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.499402  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0458  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.02 
 
 		 663 aa  661    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1548  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.19 
 
 		 663 aa  663    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0398  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.67 
 
 		 668 aa  741    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0637  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.72 
 
 		 669 aa  729    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1777  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.57 
 
 		 659 aa  696    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  53.69 
 
 		 668 aa  667    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1066  fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 		 614 aa  1263    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.191298  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3065  fumarate reductase flavoprotein subunit  67.16 
 
 		 619 aa  847    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1257  fumarate reductase flavoprotein subunit  69.47 
 
 		 631 aa  898    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0425  fumarate reductase flavoprotein subunit  52.75 
 
 		 672 aa  669    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1930  fumarate reductase flavoprotein subunit  56.4 
 
 		 595 aa  659    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3960  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.43 
 
 		 668 aa  727    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0394  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.55 
 
 		 666 aa  726    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.72 
 
 		 668 aa  724    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1493  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.44 
 
 		 667 aa  706    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2205  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.08 
 
 		 662 aa  677    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4114  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.05 
 
 		 674 aa  730    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000002449 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3439  fumarate reductase flavoprotein subunit  60.1 
 
 		 668 aa  735    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0395  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  54.11 
 
 		 661 aa  662    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000651077  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0404  fumarate reductase flavoprotein subunit  60.1 
 
 		 668 aa  738    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3621  fumarate reductase flavoprotein subunit  60.1 
 
 		 668 aa  738    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0457  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.02 
 
 		 666 aa  728    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.650499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0679  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.06 
 
 		 669 aa  719    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2459  fumarate reductase flavoprotein subunit  70.03 
 
 		 605 aa  873    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3883  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.6 
 
 		 668 aa  727    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000869864 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1999  fumarate reductase flavoprotein subunit  65.07 
 
 		 619 aa  844    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000679701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0403  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.21 
 
 		 668 aa  737    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  hitchhiker  0.00648266 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0415  fumarate reductase flavoprotein subunit  53.95 
 
 		 662 aa  676    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00858374  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3220  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.21 
 
 		 679 aa  723    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4076  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.6 
 
 		 668 aa  728    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.212927 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0857  fumarate reductase flavoprotein subunit  52.34 
 
 		 662 aa  651    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0127  fumarate reductase flavoprotein subunit  69.04 
 
 		 612 aa  863    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.7734  normal  0.0470081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0509  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.21 
 
 		 674 aa  731    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  decreased coverage  0.000923774 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0433  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.02 
 
 		 663 aa  661    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  38.93 
 
 		 584 aa  382  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2514  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  38.44 
 
 		 585 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.85 
 
 		 566 aa  364  2e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  38.47 
 
 		 568 aa  362  1e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.8 
 
 		 566 aa  360  5e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.46 
 
 		 579 aa  360  5e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.21 
 
 		 575 aa  356  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.57 
 
 		 605 aa  355  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.19 
 
 		 567 aa  355  1e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.23 
 
 		 605 aa  355  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.57 
 
 		 605 aa  355  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35 
 
 		 578 aa  353  5.9999999999999994e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0308  succinate dehydrogenase subunit A  38.67 
 
 		 567 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.353372 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.94 
 
 		 567 aa  349  1e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.8 
 
 		 598 aa  347  3e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.38 
 
 		 567 aa  347  4e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.58 
 
 		 568 aa  346  6e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.82 
 
 		 605 aa  346  8.999999999999999e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0437  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.41 
 
 		 599 aa  343  4e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.27 
 
 		 592 aa  343  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  35.37 
 
 		 596 aa  343  5e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  37.44 
 
 		 594 aa  343  7e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02916  hypothetical protein similar to succinate dehydrogenase flavoprotein subunit A (Broad)  36.62 
 
 		 647 aa  342  1e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.056586 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0127  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.81 
 
 		 567 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.864238  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  37.48 
 
 		 567 aa  340  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0380  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.4 
 
 		 596 aa  340  4e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.05 
 
 		 611 aa  340  4e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0344  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.07 
 
 		 596 aa  340  5e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0479  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.54 
 
 		 607 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.33 
 
 		 592 aa  339  9e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.33 
 
 		 592 aa  339  9e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.69 
 
 		 612 aa  339  9e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.33 
 
 		 592 aa  339  9e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.9 
 
 		 591 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.9 
 
 		 591 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.05 
 
 		 589 aa  339  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.05 
 
 		 589 aa  339  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.9 
 
 		 591 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.9 
 
 		 591 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.9 
 
 		 591 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.48 
 
 		 567 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.33 
 
 		 592 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.9 
 
 		 591 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.76 
 
 		 567 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.9 
 
 		 591 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.47 
 
 		 596 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.74 
 
 		 591 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2749  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.88 
 
 		 612 aa  338  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.04 
 
 		 595 aa  338  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.56 
 
 		 595 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.65 
 
 		 575 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0044  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.94 
 
 		 596 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3978  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36 
 
 		 613 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1467  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.75 
 
 		 587 aa  337  5.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38125  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.86 
 
 		 595 aa  336  7e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.82 
 
 		 592 aa  336  7.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0688  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.92 
 
 		 598 aa  336  9e-91  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3690  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36 
 
 		 613 aa  336  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.68 
 
 		 592 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6040  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.8 
 
 		 608 aa  335  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0230  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.7 
 
 		 611 aa  335  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>