More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1257 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0642  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.31 
 
 
669 aa  726    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3935  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.77 
 
 
668 aa  738    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0615  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.31 
 
 
669 aa  726    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0458  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.66 
 
 
663 aa  699    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0398  fumarate reductase flavoprotein subunit  60.67 
 
 
668 aa  744    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.67 
 
 
668 aa  735    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0425  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.12 
 
 
672 aa  684    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1777  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.83 
 
 
659 aa  687    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3960  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.93 
 
 
668 aa  740    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1531  fumarate reductase flavoprotein subunit  77.81 
 
 
618 aa  1004    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.499402  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1066  fumarate reductase flavoprotein subunit  69.47 
 
 
614 aa  898    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.191298  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0433  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.66 
 
 
663 aa  700    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1257  fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 
631 aa  1311    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0857  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.23 
 
 
662 aa  665    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1930  fumarate reductase flavoprotein subunit  56.44 
 
 
595 aa  681    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3750  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.47 
 
 
669 aa  727    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4076  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.93 
 
 
668 aa  740    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.212927 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4114  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.67 
 
 
674 aa  742    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000002449 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3065  fumarate reductase flavoprotein subunit  69.84 
 
 
619 aa  905    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1493  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.74 
 
 
667 aa  709    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.66 
 
 
668 aa  706    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3883  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.93 
 
 
668 aa  738    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000869864 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0404  fumarate reductase flavoprotein subunit  60.59 
 
 
668 aa  748    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3621  fumarate reductase flavoprotein subunit  60.59 
 
 
668 aa  748    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1548  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.66 
 
 
663 aa  699    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0457  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.5 
 
 
666 aa  736    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.650499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0679  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.02 
 
 
669 aa  723    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0394  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.33 
 
 
666 aa  736    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2205  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.34 
 
 
662 aa  697    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1999  fumarate reductase flavoprotein subunit  70.77 
 
 
619 aa  905    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000679701  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0637  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.31 
 
 
669 aa  726    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0403  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.17 
 
 
668 aa  748    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  hitchhiker  0.00648266 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0415  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.5 
 
 
662 aa  697    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00858374  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0509  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.17 
 
 
674 aa  751    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  decreased coverage  0.000923774 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3220  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.83 
 
 
679 aa  735    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2459  fumarate reductase flavoprotein subunit  72.73 
 
 
605 aa  933    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3439  fumarate reductase flavoprotein subunit  59.93 
 
 
668 aa  741    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0127  fumarate reductase flavoprotein subunit  70.42 
 
 
612 aa  923    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.7734  normal  0.0470081 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0395  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  54.62 
 
 
661 aa  678    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000651077  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  39.08 
 
 
584 aa  396  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2514  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  39.02 
 
 
585 aa  389  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136164  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  39.15 
 
 
568 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.61 
 
 
566 aa  368  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.73 
 
 
567 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.63 
 
 
579 aa  364  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.29 
 
 
617 aa  365  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.67 
 
 
567 aa  363  4e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.99 
 
 
599 aa  357  3.9999999999999996e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0382  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.95 
 
 
598 aa  356  5.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0471  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.95 
 
 
598 aa  356  8.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3936  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.65 
 
 
598 aa  355  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.87 
 
 
589 aa  353  4e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.87 
 
 
589 aa  353  4e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.08 
 
 
606 aa  353  4e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0308  succinate dehydrogenase subunit A  39.14 
 
 
567 aa  353  5e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.353372 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2230  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.52 
 
 
602 aa  353  5.9999999999999994e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.76 
 
 
568 aa  352  1e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  38.39 
 
 
567 aa  352  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4704  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.22 
 
 
596 aa  352  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.698636  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4621  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.22 
 
 
596 aa  352  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.98 
 
 
598 aa  351  2e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3758  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.97 
 
 
598 aa  351  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.57 
 
 
567 aa  351  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4761  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.22 
 
 
596 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.838458 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0127  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.07 
 
 
567 aa  347  3e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.864238  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0343  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.71 
 
 
596 aa  347  3e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  unclonable  0.00000264119 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.43 
 
 
575 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4740  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.22 
 
 
596 aa  347  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4613  fumarate reductase flavoprotein subunit  37.05 
 
 
596 aa  347  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04026  fumarate reductase  36.88 
 
 
602 aa  346  6e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3836  fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.88 
 
 
602 aa  346  6e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03988  hypothetical protein  36.88 
 
 
602 aa  346  6e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3856  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.88 
 
 
602 aa  346  6e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198988 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4713  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.88 
 
 
602 aa  346  6e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.46 
 
 
575 aa  346  8e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4686  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.88 
 
 
602 aa  345  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322244  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.41 
 
 
575 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.41 
 
 
575 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.32 
 
 
567 aa  344  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4625  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.9 
 
 
602 aa  345  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0290793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5672  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.71 
 
 
602 aa  344  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.140483 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4398  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.71 
 
 
602 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1878  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.44 
 
 
591 aa  344  4e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.178355  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0419  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.52 
 
 
598 aa  344  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000541529 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0688  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.85 
 
 
598 aa  343  5e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  39.14 
 
 
597 aa  343  5.999999999999999e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.41 
 
 
575 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  35.07 
 
 
603 aa  342  1e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1215  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.84 
 
 
590 aa  341  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.45 
 
 
542 aa  342  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.59 
 
 
592 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.59 
 
 
578 aa  340  4e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.65 
 
 
602 aa  340  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1467  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  38.44 
 
 
587 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38125  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.65 
 
 
566 aa  339  9.999999999999999e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.88 
 
 
605 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0714  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.35 
 
 
607 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3667  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.35 
 
 
607 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11584  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.82 
 
 
583 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.532611 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3813  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.35 
 
 
607 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.924769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>